More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2833 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2833  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  503  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  48.2 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0307  ABC transporter related  55.92 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0968  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 276 aa  204  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.315946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  42.17 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  47.03 
 
 		 274 aa  188  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 		 434 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  46.55 
 
 		 448 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  45.22 
 
 		 438 aa  186  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.93 
 
 		 245 aa  184  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  45.87 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  43.14 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  43.85 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  42.21 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  50.72 
 
 		 244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  45.28 
 
 		 252 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  44.39 
 
 		 251 aa  181  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  45.28 
 
 		 252 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  45.28 
 
 		 252 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  49.3 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.09 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  44.73 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  39.68 
 
 		 262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  44.12 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  42.04 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  45.63 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3488  ABC transporter related  49.38 
 
 		 251 aa  178  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.841984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  46.85 
 
 		 244 aa  178  8e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  48.89 
 
 		 281 aa  178  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  44.5 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  47.98 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3796  ABC transporter related  48.56 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  43.35 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  43.25 
 
 		 439 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  43.81 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5895  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  47.14 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0163214  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.15 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  45.18 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  40.77 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  44.5 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  40.71 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4373  ABC transporter related  42.41 
 
 		 297 aa  175  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 437 aa  175  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  43.57 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.89 
 
 		 281 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  45.75 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  45.12 
 
 		 445 aa  175  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  44.55 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  42.26 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  41.98 
 
 		 450 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  45.5 
 
 		 244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  44.59 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1398  ABC transporter related  39.62 
 
 		 288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.25 
 
 		 448 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  46.48 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  43.67 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  43.86 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  43.86 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  44.29 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  42.13 
 
 		 445 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0667  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.21 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.024802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  43.86 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  41.2 
 
 		 304 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  42.26 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1413  ABC transporter related  47.47 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  44.29 
 
 		 436 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  45.27 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  45.27 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3485  putative nitrate transport system ATP-binding protein  38.74 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  46.09 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  42.4 
 
 		 448 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  42.4 
 
 		 453 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  45.12 
 
 		 445 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  42.4 
 
 		 448 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  42.4 
 
 		 445 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.4 
 
 		 445 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  42.4 
 
 		 445 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  42.4 
 
 		 448 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  42.4 
 
 		 445 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  42.4 
 
 		 445 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  42.4 
 
 		 448 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.72 
 
 		 448 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5413  putative nitrate ABC transporter ATP-binding protein (ntrC/D-like protein)  40.95 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  40.7 
 
 		 258 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  44.02 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  46.05 
 
 		 253 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  45.22 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34780  putative ABC transporter ATP-binding component  45.33 
 
 		 282 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0748092  normal  0.0155255 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.3 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  40.37 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>