281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1521 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 202 aa  416  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  40.79 
 
 		 199 aa  138  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  40.15 
 
 		 194 aa  104  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  37.23 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  37.23 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  37.23 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  37.23 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  37.23 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  37.23 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  33.5 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  36.5 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  40.15 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  40.15 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  37.96 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  31.39 
 
 		 444 aa  79.7  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  31.54 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  29.05 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  27.46 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  27.46 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  27.46 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  27.46 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  27.46 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  27.46 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  27.46 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  27.46 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  27.46 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  29.93 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  31.06 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  26.76 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  26.76 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  30.07 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  36.13 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  25.55 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  26.72 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  39.39 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  28.19 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  28.47 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  28.12 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  25.68 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  25.68 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  25.68 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  25.68 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  25.68 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  25.68 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  27.52 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  26.34 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  33.55 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  28.95 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  33.65 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  27.74 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  28.66 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  28.67 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 275 aa  62  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  28.91 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  27.03 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  29.13 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  28.66 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  27.7 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  27.86 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  27.86 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  30.14 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  27.7 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  25.68 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  27.91 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  33.08 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  27.7 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  27.7 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  27.7 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  28.08 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  25.19 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  30.36 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  30.14 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  29.37 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  29.32 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  28.16 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  29.45 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  26.71 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  27.03 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  25.9 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  26.58 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  29.3 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  28.37 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  30.41 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  29.13 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  28.17 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  29.13 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  25.9 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  26.09 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  25.95 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  25.95 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  26.09 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  25.76 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>