More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0198 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 474 aa  942    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  58.94 
 
 		 479 aa  549  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  44.77 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  43.88 
 
 		 478 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  46.33 
 
 		 462 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  43.05 
 
 		 460 aa  355  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  43.65 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2149  cation diffusion facilitator family transporter  45.33 
 
 		 460 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  40.18 
 
 		 460 aa  339  7e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 		 460 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1201  cation efflux protein  42.38 
 
 		 460 aa  326  5e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 		 459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  36.5 
 
 		 459 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  33.19 
 
 		 483 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  33.48 
 
 		 481 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  33.4 
 
 		 466 aa  232  9e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  35.53 
 
 		 483 aa  221  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  28.33 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  30.38 
 
 		 488 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  26.09 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  32.98 
 
 		 311 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 		 311 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  30.14 
 
 		 307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  32.87 
 
 		 308 aa  127  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  31.25 
 
 		 297 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 328 aa  126  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  30.83 
 
 		 354 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  30.04 
 
 		 307 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  28.09 
 
 		 318 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  30.6 
 
 		 298 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  29.41 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  30.15 
 
 		 297 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  28.83 
 
 		 298 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  31.93 
 
 		 311 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 		 308 aa  113  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  27.21 
 
 		 450 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  27.84 
 
 		 290 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  28.82 
 
 		 292 aa  113  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  28.95 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  31.36 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  30.16 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  26.89 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  26.81 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.94 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  29.04 
 
 		 292 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  31.44 
 
 		 301 aa  110  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  27.96 
 
 		 290 aa  110  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  28.1 
 
 		 312 aa  110  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  28.53 
 
 		 315 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  29.54 
 
 		 309 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  28.11 
 
 		 302 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  29.68 
 
 		 327 aa  109  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  30.32 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  26.74 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  27.84 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  27.59 
 
 		 311 aa  107  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  28.72 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  24.91 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  29.64 
 
 		 285 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  26.12 
 
 		 296 aa  105  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 		 297 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  26.17 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  28.42 
 
 		 289 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 		 305 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  27.52 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 		 293 aa  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  24.63 
 
 		 300 aa  103  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  24.31 
 
 		 306 aa  103  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  24.65 
 
 		 306 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  24.63 
 
 		 300 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  25.72 
 
 		 298 aa  103  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  25 
 
 		 300 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  24.68 
 
 		 295 aa  103  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  28.27 
 
 		 314 aa  103  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  28.77 
 
 		 323 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  30.47 
 
 		 293 aa  103  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  25 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  25 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  27.37 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  25 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  25 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  26.97 
 
 		 291 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  26.37 
 
 		 289 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  30.68 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  24.26 
 
 		 300 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  31.08 
 
 		 289 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  28.03 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  29.29 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  26.41 
 
 		 299 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  23.81 
 
 		 295 aa  100  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 		 312 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  23.81 
 
 		 295 aa  100  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  29 
 
 		 307 aa  100  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 		 310 aa  100  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  24.72 
 
 		 300 aa  99.8  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  27.9 
 
 		 332 aa  99.8  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  23.81 
 
 		 301 aa  99.8  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  26.48 
 
 		 302 aa  99.8  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>