More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0846 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  100 
 
 		 442 aa  870    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0866  general substrate transporter  44.04 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580989  normal  0.629225 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  41.28 
 
 		 460 aa  293  4e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1598  general substrate transporter  38.22 
 
 		 456 aa  243  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0615669  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  35.15 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  31.93 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  33.05 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 477 aa  200  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  34.97 
 
 		 469 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  32.89 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  32.3 
 
 		 465 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  31.6 
 
 		 441 aa  173  5e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  31.6 
 
 		 443 aa  172  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  31.26 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  30.39 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  30.39 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03960  phosphate transporter, putative  27.13 
 
 		 555 aa  146  8.000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.362408  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  30.63 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  31.63 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  30.18 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82453  inorganic phosphate transporter, transmembrane protein  26.12 
 
 		 555 aa  136  9e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10716  normal  0.589163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  26.39 
 
 		 445 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  27.39 
 
 		 443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  27.07 
 
 		 443 aa  130  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  27.23 
 
 		 452 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  27.07 
 
 		 443 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 443 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  27.07 
 
 		 443 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 443 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  27.07 
 
 		 443 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  27.07 
 
 		 443 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  28.35 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  26.91 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.15 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  26.91 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  27.15 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  27.15 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.15 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  28.19 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  27.45 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  28.41 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  28.41 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  28.35 
 
 		 458 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1117  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.316307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 442 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  27.8 
 
 		 493 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31573  permease involved in the uptake of glycerophosphoinositol (GroPIns)  25.17 
 
 		 508 aa  104  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  25.47 
 
 		 457 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 452 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 452 aa  97.4  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  26.12 
 
 		 452 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  25.33 
 
 		 472 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50547  glycerophosphoinositol permease  25.5 
 
 		 530 aa  94.7  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 451 aa  94  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.01 
 
 		 468 aa  93.2  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  25.81 
 
 		 442 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  26.86 
 
 		 475 aa  93.2  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  27.09 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  24.63 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  24.63 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  24.84 
 
 		 499 aa  90.9  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  24.63 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  26.73 
 
 		 445 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 441 aa  90.5  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 474 aa  90.1  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 462 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65748  glycerophosphoinositol permease  23.66 
 
 		 515 aa  89.7  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 469 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  26.28 
 
 		 445 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  28.02 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 445 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  26.28 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  24.76 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  26.28 
 
 		 445 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  26.28 
 
 		 445 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  26.33 
 
 		 450 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  26.28 
 
 		 445 aa  89.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 447 aa  89  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  24.76 
 
 		 399 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  29 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>