More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2898 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
149 aa  302  9.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  43.92 
 
 
158 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  41.89 
 
 
161 aa  118  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  46.31 
 
 
166 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  41.96 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  41.26 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  43.15 
 
 
150 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 
147 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  39.16 
 
 
142 aa  100  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  34.72 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  35.71 
 
 
146 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  44.06 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  39.04 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  37.67 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 
176 aa  94.4  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  43.69 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
143 aa  94  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  38.94 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  40.65 
 
 
170 aa  91.3  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  37.06 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  34.64 
 
 
155 aa  90.1  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  36.81 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  36.81 
 
 
144 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
147 aa  89  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 
178 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  36.64 
 
 
178 aa  87.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 
180 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  37.31 
 
 
156 aa  86.7  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  31.47 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  37.91 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  35.37 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  38.98 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
181 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
181 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
171 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  36.77 
 
 
177 aa  84  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  37.93 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  42.39 
 
 
167 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  35.37 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  35.29 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  37.16 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  38.39 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  39.72 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 
189 aa  80.5  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  38.97 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  36.57 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  35.71 
 
 
231 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  37.14 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  29.2 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  34.51 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  39.01 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  40.45 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  35.06 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  36.84 
 
 
173 aa  77  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  38.54 
 
 
157 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  31.72 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0154  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184978  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  35.46 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>