66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4345 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4345  SCP-like extracellular  100 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5377  SCP-like extracellular  74.83 
 
 		 168 aa  209  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  0.43557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5299  SCP-like extracellular  73.47 
 
 		 168 aa  204  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4832  SCP-like extracellular  75.71 
 
 		 142 aa  203  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.627735 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4557  SCP-like extracellular  67.16 
 
 		 169 aa  188  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  66.42 
 
 		 169 aa  185  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  47.3 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  50.33 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  51.8 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  48.67 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  50.93 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  51.8 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  48 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  50.36 
 
 		 170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  44.59 
 
 		 169 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  34.18 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  34.18 
 
 		 193 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  34.18 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  39.71 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  39.69 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  35 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.76 
 
 		 213 aa  62  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 551 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3620  Allergen V5/Tpx-1 related  33.33 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.832332  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  36.28 
 
 		 338 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  33.33 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  31.03 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  27.87 
 
 		 347 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  34.91 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  28.75 
 
 		 235 aa  54.3  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  32.41 
 
 		 264 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  31.3 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  31.93 
 
 		 209 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  44.64 
 
 		 317 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2638  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.27 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.450247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  31.9 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1200  hypothetical protein  26.67 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2861  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.83 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  29.2 
 
 		 246 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  26.67 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  31.58 
 
 		 283 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  31.58 
 
 		 283 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.08 
 
 		 279 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  31.58 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  25 
 
 		 322 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  28.46 
 
 		 320 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  30 
 
 		 310 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2897  Allergen V5/Tpx-1 related  23.6 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.870748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  31.51 
 
 		 282 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  35.59 
 
 		 283 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  31.68 
 
 		 293 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3865  SCP-like extracellular  28.76 
 
 		 207 aa  44.3  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  30 
 
 		 288 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  31.45 
 
 		 353 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  28.07 
 
 		 245 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  32.46 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  35.48 
 
 		 294 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  28.81 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  27.78 
 
 		 254 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  26.96 
 
 		 541 aa  42  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  28.16 
 
 		 264 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2786  Allergen V5/Tpx-1 related  31.3 
 
 		 194 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  30.84 
 
 		 331 aa  41.2  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  27.97 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.71 
 
 		 300 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>