More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3045 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3045  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 414 aa  798    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  83.98 
 
 		 420 aa  618  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4358  RND family efflux transporter MFP subunit  81.55 
 
 		 421 aa  600  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1349  RND family efflux transporter MFP subunit  78.5 
 
 		 423 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.5 
 
 		 416 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  59.14 
 
 		 427 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1619  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  61.82 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0869  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  58.9 
 
 		 409 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1902  secretion protein HlyD  60.05 
 
 		 409 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.555792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.21 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.03 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1362  RND family efflux transporter MFP subunit  61.63 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  decreased coverage  0.00389749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  60.53 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  53.16 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  54.38 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  55.65 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3429  secretion protein HlyD  60.28 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0320  RND family efflux transporter MFP subunit  61.18 
 
 		 407 aa  364  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.92 
 
 		 396 aa  356  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.38 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0063  RND family efflux transporter MFP subunit  56.29 
 
 		 402 aa  345  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1112  transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  54.39 
 
 		 438 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.680549 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4335  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.49 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.49 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  52.21 
 
 		 387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.39 
 
 		 424 aa  326  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  50.42 
 
 		 405 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  50.42 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  51.51 
 
 		 418 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  49.48 
 
 		 410 aa  318  9e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  49.86 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  49.86 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  49.86 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  49.86 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  48.18 
 
 		 411 aa  312  6.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  47.16 
 
 		 408 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  50.59 
 
 		 409 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  50.59 
 
 		 409 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  49.03 
 
 		 406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  49.03 
 
 		 406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  49.03 
 
 		 406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  49.03 
 
 		 409 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1792  secretion protein HlyD  46.25 
 
 		 412 aa  298  9e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.567297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3373  RND family efflux transporter MFP subunit  49.58 
 
 		 405 aa  298  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4634  RND family efflux transporter MFP subunit  45.64 
 
 		 429 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.24851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  45.96 
 
 		 417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  47.31 
 
 		 412 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  43.62 
 
 		 414 aa  280  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3099  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  43.9 
 
 		 414 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165228  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2511  RND family efflux transporter MFP subunit  46.67 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504694  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2967  secretion protein HlyD  44.87 
 
 		 413 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2891  RND efflux system membrane fusion protein  48.82 
 
 		 391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81851  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3425  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.11 
 
 		 413 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2337  RND family efflux transporter MFP subunit  46.11 
 
 		 413 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2792  RND family efflux transporter MFP subunit  45.85 
 
 		 412 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1298  secretion protein HlyD  61.41 
 
 		 253 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2448  RND family efflux transporter MFP subunit  46.39 
 
 		 413 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3181  RND family efflux transporter MFP subunit  45.56 
 
 		 412 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1073  RND family efflux transporter MFP subunit  45.09 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1145  RND family efflux transporter MFP subunit  45.09 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00324803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3182  RND family efflux transporter MFP subunit  45.27 
 
 		 412 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1077  RND family efflux transporter MFP subunit  45.09 
 
 		 412 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1187  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.27 
 
 		 412 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.917574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3325  RND family efflux transporter MFP subunit  45.27 
 
 		 412 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3493  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE  44.93 
 
 		 476 aa  266  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4124  RND family efflux transporter MFP subunit  43.82 
 
 		 415 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32400  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  45.45 
 
 		 414 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2745  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  46.04 
 
 		 414 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03218  Membrane-fusion protein  41.88 
 
 		 428 aa  258  9e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5121  RND family efflux transporter MFP subunit  45.29 
 
 		 396 aa  255  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3079  secretion protein HlyD  38.6 
 
 		 418 aa  249  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.787711  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  42.11 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33860  multidrug efflux RND membrane protein, HlyD family  45.27 
 
 		 412 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  42.94 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3985  RND family efflux transporter MFP subunit  39.44 
 
 		 410 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0887  secretion protein HlyD  39.46 
 
 		 398 aa  239  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1567  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.41 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2311  secretion protein HlyD  42.68 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4053  RND family efflux transporter MFP subunit  40.46 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  41.41 
 
 		 393 aa  234  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  37.99 
 
 		 384 aa  233  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.76 
 
 		 377 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5071  RND family efflux transporter MFP subunit  38.58 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212583  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  39.57 
 
 		 382 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0042  secretion protein HlyD  39.77 
 
 		 391 aa  226  7e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  38.3 
 
 		 392 aa  226  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  44 
 
 		 404 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  37.9 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0761316  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  43.2 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2293  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.3 
 
 		 430 aa  224  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1891  RND family efflux transporter MFP subunit  40.84 
 
 		 391 aa  223  6e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.497754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.32 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815107  normal  0.264656 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.72 
 
 		 392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.93 
 
 		 436 aa  220  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4509  RND family efflux transporter MFP subunit  36.94 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4972  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.94 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.956167  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2464  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.22 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1004  HlyD family secretion protein  42.14 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  38.1 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1152  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.23 
 
 		 435 aa  217  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00127856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>