More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2711 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
399 aa  775    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  67.27 
 
 
419 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  67.01 
 
 
419 aa  497  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  66.16 
 
 
397 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5212  glycosyl transferase group 1  62.93 
 
 
416 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  61.39 
 
 
468 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  46.63 
 
 
378 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  44.47 
 
 
377 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  44.81 
 
 
377 aa  272  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  47.13 
 
 
380 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  46.86 
 
 
377 aa  267  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  45.65 
 
 
389 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  45.11 
 
 
384 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  40.49 
 
 
389 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1155  glycosyl transferase, group 1  39.67 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596903  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  38.48 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  38.32 
 
 
389 aa  239  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  39.64 
 
 
387 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1664  glycosyl transferase  39.26 
 
 
378 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3001  glycosyl transferase group 1  44.59 
 
 
406 aa  209  9e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.469537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 
394 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
378 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
377 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.4 
 
 
769 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
400 aa  97.8  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  42.76 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 
384 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
385 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
409 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
377 aa  93.2  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  30.21 
 
 
419 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
367 aa  90.1  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  35.81 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  28.14 
 
 
346 aa  88.2  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
369 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
373 aa  87  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
414 aa  87  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
398 aa  86.7  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  23.61 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
374 aa  86.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
382 aa  84  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.25 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  36.21 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  28.81 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  24.32 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.77 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.77 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
904 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.16 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  35.12 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.25 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  22.74 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
367 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  35.16 
 
 
452 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  42.22 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.33 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  29.7 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  31.22 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  31.09 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  31.09 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.41 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  34.18 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
372 aa  77  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  28.57 
 
 
486 aa  77  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
389 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  38.37 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
400 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
440 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  37.43 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  37.34 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.82 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
452 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>