238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1937 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  587  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  80.55 
 
 
293 aa  461  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  79.25 
 
 
311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  52.4 
 
 
292 aa  318  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  51.72 
 
 
297 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  50.34 
 
 
297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  54.83 
 
 
291 aa  299  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  53.24 
 
 
296 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  51.2 
 
 
293 aa  295  8e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  54.33 
 
 
294 aa  292  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  52.96 
 
 
304 aa  288  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  48.28 
 
 
298 aa  285  5e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  51.72 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  51.01 
 
 
294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  50.34 
 
 
290 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  51.01 
 
 
294 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  51.01 
 
 
294 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  50.68 
 
 
294 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  52.6 
 
 
311 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  52.53 
 
 
295 aa  275  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  51.85 
 
 
295 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  50.87 
 
 
299 aa  269  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  50.68 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  49.83 
 
 
303 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  50.34 
 
 
294 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  50.84 
 
 
309 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  50 
 
 
294 aa  264  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  50.34 
 
 
295 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  52.05 
 
 
295 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  46.44 
 
 
297 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  50.17 
 
 
309 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  50.51 
 
 
309 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  50.51 
 
 
309 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  50.17 
 
 
309 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  50.17 
 
 
309 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  50.17 
 
 
309 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  50.17 
 
 
309 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  50.17 
 
 
309 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  50.17 
 
 
309 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  49.83 
 
 
309 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  50.17 
 
 
309 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  50.17 
 
 
309 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  50.17 
 
 
309 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  47.3 
 
 
301 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  50.17 
 
 
309 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  49.83 
 
 
309 aa  258  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  50.34 
 
 
305 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  50.17 
 
 
309 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  50.17 
 
 
309 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  50.51 
 
 
312 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  49.66 
 
 
300 aa  255  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  50.17 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  49.16 
 
 
300 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  47.14 
 
 
300 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  39.65 
 
 
275 aa  206  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  41.64 
 
 
272 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  41.3 
 
 
272 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  41.3 
 
 
272 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  38.41 
 
 
281 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  37.85 
 
 
273 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  38.28 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  37.93 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  35.99 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  37.19 
 
 
272 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  38.62 
 
 
272 aa  176  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.79 
 
 
289 aa  176  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  38.25 
 
 
271 aa  175  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  36.24 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  38.65 
 
 
313 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  40 
 
 
272 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  34.92 
 
 
312 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  35.11 
 
 
334 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  36.59 
 
 
326 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  34.08 
 
 
310 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  34.8 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  36.51 
 
 
306 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.83 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  35.03 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  34.71 
 
 
321 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  34.1 
 
 
287 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  39.31 
 
 
274 aa  159  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  36.58 
 
 
321 aa  158  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  35.59 
 
 
276 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  38.06 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  38.06 
 
 
274 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  34.84 
 
 
293 aa  155  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  31.87 
 
 
310 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  31.25 
 
 
310 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  33.44 
 
 
309 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  35.91 
 
 
309 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  35.76 
 
 
309 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  33.55 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  35.17 
 
 
281 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.22 
 
 
305 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  31.87 
 
 
310 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  34.98 
 
 
309 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  35.49 
 
 
309 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.69 
 
 
280 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  37.3 
 
 
308 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  36.31 
 
 
314 aa  149  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>