More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4008 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4008  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 282 aa  550  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  49.8 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2594  DeoR family transcriptional regulator  51.38 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1363  regulatory protein DeoR  46.37 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.212224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1563  transcriptional regulator, DeoR family  45.97 
 
 		 250 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0289258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1308  transcriptional regulator, DeoR family  45.97 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  40.4 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  41.2 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  39.07 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0971  DeoR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  40.08 
 
 		 256 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  39.34 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  36.76 
 
 		 256 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.71 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  35.17 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.71 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  32 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  32 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  30.04 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 257 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.76 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 259 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  33.6 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.58 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  36.21 
 
 		 253 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  36.65 
 
 		 258 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  32.52 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  29.96 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  29.96 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.96 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.96 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.05 
 
 		 251 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.05 
 
 		 251 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  29.96 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  40.08 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.38 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2172  DeoR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.96 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.38 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.38 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.38 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.38 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.96 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 259 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.96 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  39.21 
 
 		 253 aa  116  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 294 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.43 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  30.4 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  32.31 
 
 		 248 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  32.38 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  34.55 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.55 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.43 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3044  glycerol-3-phosphate regulon repressor transcription regulator protein  30.8 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  32.46 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  36 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  30.4 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2706  transcriptional regulator, DeoR family  39.66 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  37.36 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.58 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  36.23 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  30.52 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  29.52 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  32.16 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  32.16 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  37.02 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  30.92 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.84 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  33.2 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  37 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.55 
 
 		 257 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.55 
 
 		 257 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>