More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3964 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
1264 aa  2629    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
703 aa  256  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 
643 aa  252  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.22 
 
 
643 aa  251  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0340  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.78 
 
 
643 aa  237  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0325  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.07 
 
 
643 aa  231  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0305  hypothetical protein  32.26 
 
 
423 aa  216  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  24.61 
 
 
1239 aa  185  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  35.55 
 
 
756 aa  159  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  23.41 
 
 
1247 aa  153  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0317  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 
329 aa  143  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0399103  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.27 
 
 
443 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0039  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
399 aa  131  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
424 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0126  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
699 aa  129  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
857 aa  115  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  31.82 
 
 
849 aa  112  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
665 aa  111  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2562  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.96 
 
 
578 aa  111  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  33.33 
 
 
1632 aa  107  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.33 
 
 
1806 aa  107  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  34.87 
 
 
2342 aa  107  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
388 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
365 aa  106  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  35.38 
 
 
2342 aa  105  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
374 aa  105  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2777  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
406 aa  103  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  28.99 
 
 
428 aa  101  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
386 aa  99.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
1067 aa  98.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
396 aa  98.2  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 
846 aa  98.2  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 
364 aa  97.8  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
368 aa  96.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 
371 aa  96.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  33.33 
 
 
2796 aa  96.3  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
461 aa  94  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
364 aa  93.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
353 aa  91.7  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 
361 aa  91.7  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
394 aa  90.9  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
419 aa  90.9  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
987 aa  89.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.59 
 
 
916 aa  89.4  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1200  glycosyl transferase group 1  37.88 
 
 
384 aa  89.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
418 aa  89  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.84 
 
 
375 aa  89  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
350 aa  88.6  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  32.57 
 
 
440 aa  88.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
660 aa  87.8  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
388 aa  87.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.1 
 
 
1366 aa  87  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
388 aa  86.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
890 aa  86.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  29.67 
 
 
416 aa  86.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
656 aa  85.1  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 
409 aa  84  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  28.08 
 
 
513 aa  84  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  24.59 
 
 
358 aa  84  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
872 aa  83.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  29.17 
 
 
521 aa  83.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  38.4 
 
 
250 aa  82.8  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  21.72 
 
 
1236 aa  82.8  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13941  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.164245  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  26.09 
 
 
347 aa  80.5  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
384 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
762 aa  80.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
678 aa  80.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
372 aa  79.7  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 
765 aa  79.7  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2576  glycosyl transferase group 1  22.14 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731131  normal  0.452849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
390 aa  79  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  26.21 
 
 
354 aa  79  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  29.76 
 
 
385 aa  79  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  37.86 
 
 
750 aa  79  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
756 aa  78.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  23.17 
 
 
828 aa  78.2  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4938  glycosyl transferase, putative  35.21 
 
 
379 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  19.35 
 
 
812 aa  78.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  37.24 
 
 
369 aa  77.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
409 aa  78.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4810  glycosyl transferase, group 1  39.34 
 
 
363 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
320 aa  77.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
303 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
1059 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  47.5 
 
 
115 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 
414 aa  77.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 
398 aa  77  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
746 aa  77.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
1035 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
1044 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
425 aa  77  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3443  hypothetical protein  25.2 
 
 
823 aa  76.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0239655  normal  0.271083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>