More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3719 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3719  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  899    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4675  ATPase central domain-containing protein  75.2 
 
 		 720 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5669  AAA ATPase central domain protein  38.91 
 
 		 699 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0985  AAA ATPase central domain protein  35.95 
 
 		 683 aa  144  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3837  AAA ATPase central domain protein  35.43 
 
 		 715 aa  136  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1566  AAA ATPase central domain protein  51.4 
 
 		 625 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20815  hitchhiker  0.00245284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0020  AAA ATPase, central region  43.71 
 
 		 697 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1247  hypothetical protein  70.59 
 
 		 68 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1361  AAA ATPase, central region  35.51 
 
 		 704 aa  99  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252526  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1202  ATPase central domain-containing protein  47.47 
 
 		 627 aa  91.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0870142  normal  0.869838 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1422  ATPase central domain-containing protein  50.5 
 
 		 715 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0808  ATPase central domain-containing protein  50.5 
 
 		 715 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1816  ATPase central domain-containing protein  35.68 
 
 		 590 aa  86.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0194  AAA ATPase central domain protein  46.39 
 
 		 619 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3656  AAA ATPase, central region  31.91 
 
 		 694 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  32.41 
 
 		 599 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  52.46 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  34.34 
 
 		 630 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2720  membrane protease FtsH catalytic subunit  41.94 
 
 		 641 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 		 737 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  40.98 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.94 
 
 		 651 aa  55.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1903  peptidase M41, FtsH  48.39 
 
 		 629 aa  55.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.89968  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 		 737 aa  55.1  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.54 
 
 		 738 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  43.75 
 
 		 616 aa  54.3  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  45.16 
 
 		 803 aa  54.7  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_55229  predicted protein  43.55 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.94 
 
 		 625 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.03 
 
 		 610 aa  53.9  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5769  ATPase central domain-containing protein  34.17 
 
 		 637 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.03 
 
 		 610 aa  53.9  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2276  AAA ATPase, central region  45.9 
 
 		 392 aa  53.9  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00996257  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  41.94 
 
 		 623 aa  53.9  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 629 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.94 
 
 		 656 aa  53.9  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 631 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 631 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 629 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 631 aa  53.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  44.44 
 
 		 628 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  44.44 
 
 		 628 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 628 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  44.44 
 
 		 627 aa  53.5  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  44.44 
 
 		 628 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  44.44 
 
 		 632 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17504  predicted protein  40.32 
 
 		 673 aa  53.5  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  44.44 
 
 		 628 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  44.44 
 
 		 628 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 628 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.75 
 
 		 736 aa  53.5  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.45 
 
 		 635 aa  53.5  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  44.44 
 
 		 628 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  44.44 
 
 		 629 aa  53.5  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.32 
 
 		 628 aa  53.5  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 627 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 631 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 631 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.03 
 
 		 607 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 628 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 628 aa  53.5  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1738  membrane protease FtsH catalytic subunit  40.32 
 
 		 628 aa  53.5  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83044  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.32 
 
 		 662 aa  53.1  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 649 aa  53.5  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  25.68 
 
 		 637 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  44.44 
 
 		 621 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  44.44 
 
 		 628 aa  53.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 623 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  41.94 
 
 		 638 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0429  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.95 
 
 		 626 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0157524  hitchhiker  0.00156876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.55 
 
 		 616 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2307  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.9 
 
 		 599 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0665193  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.71 
 
 		 627 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1916  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.9 
 
 		 598 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  44.44 
 
 		 645 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.71 
 
 		 651 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.71 
 
 		 655 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 645 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.55 
 
 		 612 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 646 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.94 
 
 		 646 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.94 
 
 		 640 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  41.94 
 
 		 775 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  41.27 
 
 		 630 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  40.32 
 
 		 613 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  41.94 
 
 		 613 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.71 
 
 		 644 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.94 
 
 		 616 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  40.32 
 
 		 662 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.71 
 
 		 645 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86417  mitochondrial protein of the CDC48/PAS1/SEC18 family of ATPases  43.55 
 
 		 703 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.03 
 
 		 617 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.86 
 
 		 662 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  27.93 
 
 		 637 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  42.86 
 
 		 640 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 673 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.71 
 
 		 659 aa  52.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.32 
 
 		 701 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  37.1 
 
 		 639 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.94 
 
 		 640 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>