More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3055 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0672  UvrD/REP helicase  61.99 
 
 		 595 aa  746    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0183847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3055  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 608 aa  1256    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3186  UvrD/REP helicase  56.34 
 
 		 603 aa  712    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.985169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3048  UvrD/REP helicase  92.76 
 
 		 608 aa  1166    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0267526  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1515  UvrD/REP helicase  37.62 
 
 		 575 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0347716  hitchhiker  2.10005e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4163  UvrD/REP helicase  37.9 
 
 		 550 aa  364  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.533051  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2458  UvrD/REP helicase  33.98 
 
 		 586 aa  295  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411519  normal  0.923114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0546  UvrD/REP helicase  33.28 
 
 		 569 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  24.39 
 
 		 739 aa  94.4  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  26.75 
 
 		 845 aa  91.3  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  25.26 
 
 		 715 aa  87  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  27.41 
 
 		 656 aa  85.1  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  24.05 
 
 		 741 aa  84.7  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.94 
 
 		 734 aa  84.3  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  25.4 
 
 		 735 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  21.86 
 
 		 749 aa  82  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  27.82 
 
 		 1032 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  22.97 
 
 		 743 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0795  UvrD/REP helicase  27.76 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.790736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 787 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 840 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  24.16 
 
 		 688 aa  77.8  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  25.26 
 
 		 666 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.06 
 
 		 787 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  26.06 
 
 		 846 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  26.44 
 
 		 520 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  26.06 
 
 		 787 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  26.06 
 
 		 787 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  26.76 
 
 		 783 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.16 
 
 		 662 aa  76.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  25.73 
 
 		 648 aa  75.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  25.73 
 
 		 648 aa  75.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  22.89 
 
 		 743 aa  75.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.76 
 
 		 783 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.55 
 
 		 743 aa  74.7  0.000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  23.96 
 
 		 731 aa  74.7  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.66 
 
 		 748 aa  74.7  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  24.25 
 
 		 666 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.64 
 
 		 726 aa  74.3  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  26.8 
 
 		 678 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  25.41 
 
 		 655 aa  73.9  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  22.82 
 
 		 706 aa  74.3  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  25.21 
 
 		 790 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  25.14 
 
 		 741 aa  73.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  24.66 
 
 		 630 aa  73.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  25.68 
 
 		 668 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  24.09 
 
 		 657 aa  72.8  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  24.93 
 
 		 787 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  24.93 
 
 		 787 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  24.93 
 
 		 786 aa  72  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  24.92 
 
 		 754 aa  72  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  24.93 
 
 		 787 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  23.69 
 
 		 735 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.71 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  22.85 
 
 		 724 aa  70.9  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0641  UvrD/REP helicase  25.78 
 
 		 602 aa  70.9  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  24.65 
 
 		 787 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  24.65 
 
 		 787 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  24.65 
 
 		 787 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  24.65 
 
 		 787 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  24.65 
 
 		 787 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.62 
 
 		 745 aa  70.5  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  23.78 
 
 		 773 aa  70.5  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1715  UvrD/REP helicase  23.76 
 
 		 787 aa  70.5  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  23.62 
 
 		 714 aa  70.1  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.29 
 
 		 671 aa  70.1  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  23.42 
 
 		 788 aa  69.3  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  24.91 
 
 		 765 aa  68.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.4 
 
 		 741 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.91 
 
 		 759 aa  69.7  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  23.92 
 
 		 826 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  24.25 
 
 		 722 aa  69.7  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  26.18 
 
 		 726 aa  69.3  0.0000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.92 
 
 		 816 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  24.2 
 
 		 809 aa  69.3  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  27.43 
 
 		 725 aa  69.7  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.16 
 
 		 758 aa  69.3  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1346  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.94 
 
 		 688 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  23.47 
 
 		 659 aa  68.6  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  23.3 
 
 		 789 aa  68.6  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1127  ATP-dependent DNA helicase  23.94 
 
 		 688 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  25.26 
 
 		 723 aa  68.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.16 
 
 		 713 aa  68.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1384  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  23.94 
 
 		 688 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00158737  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  25.26 
 
 		 723 aa  68.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1239  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.94 
 
 		 657 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  24.45 
 
 		 783 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1279  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  24.2 
 
 		 688 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  24.13 
 
 		 793 aa  68.2  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1146  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.94 
 
 		 688 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  26.92 
 
 		 743 aa  68.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  23.08 
 
 		 726 aa  68.2  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  22.99 
 
 		 812 aa  67.8  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1307  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  23.94 
 
 		 688 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000490806 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  24.79 
 
 		 739 aa  67.4  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1120  ATP-dependent DNA helicase  23.94 
 
 		 688 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  24.1 
 
 		 1132 aa  67.4  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.28 
 
 		 932 aa  67.4  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  25.45 
 
 		 1089 aa  67.4  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1133  UvrD/REP helicase  23.73 
 
 		 688 aa  67  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>