More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2583 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
361 aa  714    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  37.74 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 
368 aa  153  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  41.8 
 
 
346 aa  153  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  38.76 
 
 
375 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 
370 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
376 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  32.41 
 
 
369 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 
393 aa  136  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 
361 aa  134  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  38.25 
 
 
309 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
364 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  31.99 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
365 aa  129  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
374 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.24 
 
 
396 aa  122  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 
399 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.87 
 
 
372 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  44.91 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  27.37 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  34.81 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
439 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.6 
 
 
373 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  28.08 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  28.12 
 
 
399 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
396 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
377 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  43.33 
 
 
368 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 
381 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  40.72 
 
 
419 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.44 
 
 
420 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 
390 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.01 
 
 
392 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
409 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.23 
 
 
415 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.01 
 
 
420 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.01 
 
 
392 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.14 
 
 
386 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  27.68 
 
 
365 aa  106  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.1 
 
 
420 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.1 
 
 
420 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.1 
 
 
420 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  27.69 
 
 
379 aa  105  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
348 aa  105  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  27.97 
 
 
365 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
361 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
1032 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
361 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
361 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  38.27 
 
 
364 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 
399 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
361 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
371 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  28.25 
 
 
365 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
365 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
386 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
361 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  36.9 
 
 
440 aa  99.8  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.2 
 
 
361 aa  99.8  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
361 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
362 aa  99.4  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  38.6 
 
 
660 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
371 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
424 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.88 
 
 
374 aa  97.1  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 
361 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
371 aa  96.7  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
376 aa  96.7  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
359 aa  96.7  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
374 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 
384 aa  96.3  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  26.36 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  37.79 
 
 
420 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
385 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  36.43 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.01 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
386 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  37.16 
 
 
377 aa  93.6  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 
370 aa  93.6  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
374 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  35.98 
 
 
357 aa  93.6  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
375 aa  93.6  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
365 aa  92.8  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
386 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
353 aa  92.8  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  36.77 
 
 
416 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
669 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  34.95 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.53 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4987  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.26 
 
 
359 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  37.71 
 
 
394 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
762 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3024  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
356 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>