More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1826 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  55.88 
 
 		 555 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  55.88 
 
 		 555 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.04 
 
 		 559 aa  700    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6356  putative ABC transporter ATP-binding protein  84.36 
 
 		 550 aa  948    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109322 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 555 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 		 555 aa  686    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  648    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3474  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.52 
 
 		 551 aa  891    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128055  normal  0.617651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.62 
 
 		 559 aa  646    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  72 
 
 		 549 aa  817    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3472  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.52 
 
 		 555 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3463  putative ABC transporter ATP-binding protein  91.09 
 
 		 550 aa  1016    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427951  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 555 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 555 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.27 
 
 		 560 aa  681    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 555 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.32 
 
 		 557 aa  657    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.68 
 
 		 557 aa  656    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.57 
 
 		 555 aa  760    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2117  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.55 
 
 		 549 aa  823    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.129596  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.13 
 
 		 551 aa  822    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.31 
 
 		 547 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.27 
 
 		 549 aa  878    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.29 
 
 		 551 aa  803    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.55 
 
 		 555 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.52 
 
 		 595 aa  659    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.44 
 
 		 556 aa  676    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.64 
 
 		 550 aa  887    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 563 aa  647    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 555 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.67 
 
 		 557 aa  682    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.04 
 
 		 559 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.29 
 
 		 551 aa  803    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.99 
 
 		 561 aa  673    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 555 aa  643    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1183  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.52 
 
 		 554 aa  642    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.976373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.49 
 
 		 559 aa  698    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1379  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.34 
 
 		 554 aa  635    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.621698  hitchhiker  0.000163615 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.87 
 
 		 561 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 		 556 aa  695    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 555 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 555 aa  648    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.28 
 
 		 561 aa  686    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 555 aa  648    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.13 
 
 		 559 aa  748    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.69 
 
 		 555 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0115  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.91 
 
 		 550 aa  868    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 555 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.27 
 
 		 549 aa  876    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.9 
 
 		 559 aa  715    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.31 
 
 		 551 aa  816    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1935  putative ABC transporter ATP-binding protein  94.55 
 
 		 550 aa  1050    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.461584  normal  0.714392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.29 
 
 		 553 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.22 
 
 		 551 aa  782    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2131  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.55 
 
 		 549 aa  880    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.0197095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.61 
 
 		 559 aa  728    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 555 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.73 
 
 		 550 aa  930    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.27 
 
 		 549 aa  875    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2713  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.36 
 
 		 550 aa  876    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.45 
 
 		 549 aa  807    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.71 
 
 		 589 aa  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.33 
 
 		 555 aa  783    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.69 
 
 		 670 aa  735    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 705 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5906  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 555 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2891  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.09 
 
 		 559 aa  730    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.315278  decreased coverage  0.00408651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.64 
 
 		 549 aa  814    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.35 
 
 		 556 aa  675    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.56 
 
 		 561 aa  680    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.01 
 
 		 551 aa  793    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3665  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 555 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 555 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1826  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 550 aa  1132    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 555 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.62 
 
 		 555 aa  697    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.58 
 
 		 558 aa  669    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.8 
 
 		 555 aa  751    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.78 
 
 		 559 aa  727    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0447  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 570 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46914  normal  0.303037 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 555 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.12 
 
 		 561 aa  666    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.76 
 
 		 560 aa  637    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1913  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.43 
 
 		 554 aa  645    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.63 
 
 		 559 aa  662    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 559 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3514  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 554 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491494  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.75 
 
 		 551 aa  818    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.95 
 
 		 584 aa  814    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0037  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 		 555 aa  644    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264543  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.69 
 
 		 558 aa  675    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  78 
 
 		 549 aa  892    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1270  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 		 555 aa  635    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158997 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1852  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.43 
 
 		 554 aa  644    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2620  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.91 
 
 		 549 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1801  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 		 553 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.124805  normal  0.0665876 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0959  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.45 
 
 		 549 aa  781    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.465393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 555 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>