288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0383 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  100 
 
 		 255 aa  494  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  84.71 
 
 		 255 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  83.92 
 
 		 255 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  67.76 
 
 		 253 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1708  phosphoribosyltransferase  64.8 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0852956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  67.93 
 
 		 279 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  54.73 
 
 		 264 aa  252  5.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  54.94 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  48.99 
 
 		 262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  54.87 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  51.04 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  51.74 
 
 		 262 aa  228  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  53.53 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 		 271 aa  223  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  50.22 
 
 		 258 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  52.67 
 
 		 272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  49.17 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  51.74 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  53.39 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  50.4 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  47.43 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  51.49 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  54.11 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  45.92 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3006  phosphoribosyltransferase  47.64 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  45.08 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  41.13 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 		 217 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  40.59 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  44.49 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  39.22 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  28.95 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  42.45 
 
 		 215 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  37.04 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  29.91 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  39.01 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  36.44 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  36.19 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  37.29 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  38.46 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.59 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  39.09 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  37.39 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  36.33 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 		 239 aa  122  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  34.43 
 
 		 245 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  36.73 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  34.89 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  39.84 
 
 		 256 aa  119  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  36.63 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  33.62 
 
 		 227 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  38.17 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  26.03 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  36.29 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  44.57 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  36.61 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2585  competence protein F  37.34 
 
 		 245 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  35.06 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  34.93 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  42.29 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  34.5 
 
 		 231 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  31.96 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  35.55 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  30.12 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  38.12 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  37.07 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  33.76 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  45.39 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  27.07 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  36.36 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  27.16 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  35.68 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  27.16 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 276 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  30.25 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1776  competence protein F, putative  36.84 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.280067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.5 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  30.99 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  36.13 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  29.34 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  32.2 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  36.75 
 
 		 241 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  31.6 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  33.62 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  31.78 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  32.38 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  37.38 
 
 		 214 aa  95.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  50 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>