More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0555 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  100 
 
 
470 aa  973    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  41.09 
 
 
454 aa  330  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.9 
 
 
519 aa  318  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1473  Rieske (2Fe-2S) region  39.36 
 
 
398 aa  226  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.826795  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  38.54 
 
 
392 aa  213  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  35.24 
 
 
440 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.17 
 
 
448 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  33.16 
 
 
438 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  31.44 
 
 
452 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  30.23 
 
 
437 aa  181  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  33.08 
 
 
439 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  31.22 
 
 
452 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  31.63 
 
 
452 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  32.03 
 
 
484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  30.32 
 
 
440 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  36.52 
 
 
440 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  31.46 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  32.27 
 
 
436 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.69 
 
 
433 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.33 
 
 
446 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.47 
 
 
408 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.47 
 
 
408 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  32.38 
 
 
417 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  32.82 
 
 
422 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.69 
 
 
443 aa  153  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  30 
 
 
431 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.68 
 
 
449 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.93 
 
 
430 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.77 
 
 
443 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.77 
 
 
443 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1910  phthalate 4,5-dioxygenase, oxygenase subunit  30.91 
 
 
438 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.41 
 
 
410 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  32.39 
 
 
437 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4627  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.94 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.8 
 
 
434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.22 
 
 
445 aa  133  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4795  phthalate 4,5-dioxygenase  31.12 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.74 
 
 
364 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  30.14 
 
 
334 aa  107  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  38.89 
 
 
327 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.32 
 
 
358 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.62 
 
 
355 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.62 
 
 
355 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.62 
 
 
355 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.62 
 
 
355 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.62 
 
 
355 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.62 
 
 
355 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.62 
 
 
355 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.42 
 
 
355 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.28 
 
 
380 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 
338 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  30.54 
 
 
380 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  29.74 
 
 
345 aa  95.5  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.5 
 
 
337 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3967  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.3 
 
 
347 aa  90.1  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.4 
 
 
356 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.9 
 
 
362 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.91 
 
 
450 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  30.23 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.96 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.94 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  27.88 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.42 
 
 
367 aa  84  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  27.01 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.01 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  28.37 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.01 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
353 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  32.24 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  31.07 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  32.34 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.28 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  29.47 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.54 
 
 
324 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  25.38 
 
 
330 aa  79.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  29.44 
 
 
352 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.91 
 
 
315 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.95 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.93 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.53 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.78 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.02 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.01 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.01 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.02 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  31.02 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.13 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.61 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.14 
 
 
370 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  31.85 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  25.74 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  29.27 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  31.76 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.76 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  30.77 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.22 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  30.95 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  29.31 
 
 
492 aa  74.7  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35581  predicted protein  33.62 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000902697  normal  0.474336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.89 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>