More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0378 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0378  pili biogenesis ATPase  100 
 
 		 583 aa  1185    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  42.01 
 
 		 493 aa  277  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  42.01 
 
 		 493 aa  277  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  42.01 
 
 		 493 aa  277  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  41.75 
 
 		 493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  41.75 
 
 		 493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  41.82 
 
 		 498 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  41.34 
 
 		 497 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  40.78 
 
 		 498 aa  270  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  40.91 
 
 		 494 aa  270  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  39.44 
 
 		 498 aa  269  8.999999999999999e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0142  general secretory pathway protein E  41.84 
 
 		 502 aa  268  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  41.35 
 
 		 497 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  39.36 
 
 		 497 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  39.79 
 
 		 586 aa  267  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  41.35 
 
 		 497 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  38.48 
 
 		 502 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  38.48 
 
 		 502 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  36.64 
 
 		 514 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  41.1 
 
 		 497 aa  264  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  38.7 
 
 		 501 aa  264  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  39.49 
 
 		 500 aa  264  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  41.1 
 
 		 497 aa  264  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  38.66 
 
 		 520 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  39.65 
 
 		 515 aa  263  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  40.62 
 
 		 505 aa  262  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 514 aa  262  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  37.26 
 
 		 523 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  39.49 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4179  type II secretion system protein E  40.16 
 
 		 482 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.262241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  39.84 
 
 		 471 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  41.15 
 
 		 498 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  38.39 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0916  general secretory pathway protein E  40.77 
 
 		 453 aa  261  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  38.66 
 
 		 509 aa  261  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  37.47 
 
 		 521 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  37.03 
 
 		 523 aa  261  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  37.47 
 
 		 521 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  37.95 
 
 		 524 aa  261  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2210  general secretory pathway protein E  40.1 
 
 		 477 aa  261  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  36.83 
 
 		 521 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1044  type II secretion system protein E  42.77 
 
 		 482 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  39.43 
 
 		 515 aa  260  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1088  type II secretion system protein E  40.16 
 
 		 482 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  37.38 
 
 		 521 aa  259  8e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  36.92 
 
 		 586 aa  259  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  39.2 
 
 		 594 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  34.68 
 
 		 482 aa  258  2e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  39.8 
 
 		 490 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  35.82 
 
 		 586 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  35.82 
 
 		 586 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  38.19 
 
 		 484 aa  257  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  35.82 
 
 		 586 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  35.58 
 
 		 586 aa  257  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5698  general secretory pathway protein E  39.95 
 
 		 453 aa  257  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  41.05 
 
 		 469 aa  257  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1047  type II secretion system protein E  39.9 
 
 		 483 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  35.7 
 
 		 586 aa  256  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  35.94 
 
 		 586 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  35.94 
 
 		 586 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  39.32 
 
 		 489 aa  256  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  35.94 
 
 		 586 aa  256  6e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  36.9 
 
 		 521 aa  256  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  41.05 
 
 		 469 aa  256  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  36.47 
 
 		 521 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  36.47 
 
 		 521 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  36.47 
 
 		 521 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  36.47 
 
 		 521 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  38.46 
 
 		 522 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  36.9 
 
 		 523 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  36.92 
 
 		 584 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1755  general secretory pathway protein E  48.07 
 
 		 462 aa  254  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.571927  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  37.11 
 
 		 499 aa  254  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  36.94 
 
 		 558 aa  254  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  40.41 
 
 		 486 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  46.21 
 
 		 494 aa  253  6e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  46.21 
 
 		 494 aa  253  9.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  38.46 
 
 		 495 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  43.33 
 
 		 553 aa  252  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  37.95 
 
 		 503 aa  252  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  37.5 
 
 		 463 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  35.58 
 
 		 586 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  39.53 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  37.6 
 
 		 520 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  36.66 
 
 		 586 aa  252  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  37.27 
 
 		 570 aa  251  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  36.15 
 
 		 585 aa  250  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  37.89 
 
 		 503 aa  250  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  38.72 
 
 		 499 aa  250  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  37.34 
 
 		 563 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  37.63 
 
 		 589 aa  250  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  39.18 
 
 		 511 aa  250  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3314  type II secretion system protein E  39.49 
 
 		 491 aa  250  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  37.21 
 
 		 519 aa  249  7e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  46.58 
 
 		 495 aa  249  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.56 
 
 		 569 aa  249  9e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.15 
 
 		 566 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  39.02 
 
 		 499 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1330  type II secretion system protein E  39.95 
 
 		 474 aa  249  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  39.02 
 
 		 499 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>