172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3688 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3688  putative signal transduction protein  100 
 
 		 280 aa  540  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0312  putative signal transduction protein  53.11 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  31.44 
 
 		 280 aa  92.4  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  27.44 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  34.72 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  29.06 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  28.72 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  29.27 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  32.98 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  26.67 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  23.94 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  31.12 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2008  putative signal transduction protein  30.26 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  24.79 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0704  hypothetical protein  26.54 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.670441  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  26.94 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  24.73 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  26.77 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0691  signal transduction protein  28.65 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  24.5 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.76 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  23.44 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  26.42 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  26.42 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0875  signal transduction protein  25.4 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.39 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  40.45 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0998  putative signal transduction protein  32.64 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  24.31 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  24.87 
 
 		 299 aa  62  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  26.02 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  24.24 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  24.14 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  26.85 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  27.45 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  23.04 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  27.55 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  33.73 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  27.32 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  28.26 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  25.58 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  25.65 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1977  putative signal transduction protein  26.4 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  26.2 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  28.79 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  25.6 
 
 		 730 aa  59.7  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  23.58 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  26.46 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  25.79 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  27.55 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  22.68 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  25.26 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  26.34 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  28.36 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  30.77 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  27.09 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  27.19 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  24.77 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  26.96 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  23.68 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  24.21 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  26.59 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  23.16 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  24.87 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  25.13 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  25.86 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  37.65 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  23.68 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  27.78 
 
 		 438 aa  55.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  29.5 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1012  putative signal transduction protein  28.74 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1569  putative signal transduction protein  30.92 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  25.21 
 
 		 517 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  22.5 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0714  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.84 
 
 		 524 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  27.53 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  28.06 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  29 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  24.1 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  24.89 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3873  Metal-dependent hydrolase HDOD  25.6 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.812708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  27.08 
 
 		 724 aa  53.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  23.4 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  29.08 
 
 		 289 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  24.08 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  22.7 
 
 		 352 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  23.32 
 
 		 291 aa  52.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0432  putative signal transduction protein  31.46 
 
 		 260 aa  52.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.299689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3872  Metal-dependent hydrolase HDOD  24.27 
 
 		 321 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0460  putative signal transduction protein  27.23 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798096  normal  0.334543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0413  hypothetical protein  24.43 
 
 		 254 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>