144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1474 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  48.39 
 
 		 156 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  64.71 
 
 		 103 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  61.76 
 
 		 103 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  56.64 
 
 		 152 aa  135  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  59.8 
 
 		 103 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  58.82 
 
 		 103 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3422  sulfur compound chelating protein SoxZ  52.94 
 
 		 103 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3128  Sulphur oxidation protein SoxZ  51.49 
 
 		 103 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3456  Sulphur oxidation protein SoxZ  51.49 
 
 		 103 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  51.96 
 
 		 103 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3258  hypothetical protein  51.49 
 
 		 103 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  45.33 
 
 		 168 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  52.04 
 
 		 102 aa  112  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  49.02 
 
 		 102 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  51.96 
 
 		 103 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  51.96 
 
 		 103 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  51.96 
 
 		 103 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  46.15 
 
 		 162 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  46.15 
 
 		 162 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  40.27 
 
 		 151 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  45.51 
 
 		 162 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  45.1 
 
 		 103 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  39.49 
 
 		 155 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  52.08 
 
 		 102 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  52.08 
 
 		 102 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  39.6 
 
 		 151 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  44.3 
 
 		 150 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  43.62 
 
 		 150 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  50.49 
 
 		 104 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  40.27 
 
 		 163 aa  95.9  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  41.06 
 
 		 156 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  41.06 
 
 		 156 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  41.18 
 
 		 103 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  39.52 
 
 		 155 aa  92.8  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  40 
 
 		 164 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  37.6 
 
 		 155 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  37.6 
 
 		 155 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  39.53 
 
 		 156 aa  88.2  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  37.18 
 
 		 162 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  39.69 
 
 		 165 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  43.75 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  28.64 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  46.99 
 
 		 110 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  46.99 
 
 		 110 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  40.43 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  38.84 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  30.29 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  40.86 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  32.48 
 
 		 157 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  40.82 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  32 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3045  hypothetical protein  38.61 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.59 
 
 		 107 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2073  Sulphur oxidation protein SoxZ  43.01 
 
 		 101 aa  75.1  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  45.35 
 
 		 98 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  35.63 
 
 		 101 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  34.64 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  31.79 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4959  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.79 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189769  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  28.95 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1520  sulphur oxidation protein SoxZ  38.82 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4254  putative sulfur oxidation protein SoxZ  40.79 
 
 		 109 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.196263  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4370  putative sulfur oxidation protein SoxZ  42.11 
 
 		 109 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  34.13 
 
 		 155 aa  71.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  29.5 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1258  sulfur covalently-binding protein  40.62 
 
 		 154 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  42.86 
 
 		 111 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  34.4 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  36.42 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2805  putative sulphur oxidation protein  38.55 
 
 		 109 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4158  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.65 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  28.43 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  33.33 
 
 		 155 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  28.43 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  37.74 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  30.62 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  27.23 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  40 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  32.48 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.5 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  27.41 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  29.03 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.66 
 
 		 102 aa  65.1  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  28.72 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  29.41 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  30.4 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  31.65 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  30.24 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0010  Sulphur oxidation protein SoxZ  43.24 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  26.81 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  31.02 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4152  sulfur oxidation Z protein  35.63 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3673  sulfur compound chelating protein SoxZ  38.16 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  37.23 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  34.19 
 
 		 150 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  31.51 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1942  sulfur oxidation protein  36.36 
 
 		 97 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>