63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0052 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  100 
 
 		 263 aa  513  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  48.64 
 
 		 272 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  49.41 
 
 		 278 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  48.99 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  50.2 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  47.41 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  47.84 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  46.75 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  45.68 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  41.53 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  37.39 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  32.04 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  33.6 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  32.77 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 278 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 		 309 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 		 318 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 313 aa  98.6  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 301 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  33.33 
 
 		 282 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  21.4 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.56 
 
 		 371 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  29.63 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 341 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16740  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.65 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.554101  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  31.89 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  21.83 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  30.8 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.98 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  21.01 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30.1 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  30.1 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.67 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  19.31 
 
 		 310 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 284 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39469  predicted protein  34.65 
 
 		 306 aa  42  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.696258  normal  0.903169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>