More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16740 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16740  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 
271 aa  565  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.554101  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04350  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.61 
 
 
271 aa  258  6e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  33.2 
 
 
272 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137124  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.64 
 
 
263 aa  72  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  22.39 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2775  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 
621 aa  65.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 
276 aa  64.7  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  26.47 
 
 
266 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  24.5 
 
 
260 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  24.5 
 
 
260 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 
279 aa  62  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  22.57 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1171  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 
278 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 
270 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  24.09 
 
 
279 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  23.41 
 
 
283 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  23.72 
 
 
281 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  25.93 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  28.03 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  20.8 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  24.4 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 
285 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  22.89 
 
 
264 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  34 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  23.62 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  22.64 
 
 
273 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  25.48 
 
 
255 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1960  hydrolase, alpha/beta fold family  20.7 
 
 
254 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000316355  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  23.14 
 
 
287 aa  55.8  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.46 
 
 
261 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 
301 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  24.64 
 
 
302 aa  55.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1088  alpha/beta fold family hydrolase  24.53 
 
 
261 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  26 
 
 
236 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  22.66 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  22.63 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  26.01 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3368  hydrolase, alpha/beta fold family  20.31 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000257055  hitchhiker  3.4538199999999996e-20 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2527  alpha/beta hydrolase fold protein  24.55 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104657  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  26.53 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  21.32 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  25.23 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  23.32 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  24.24 
 
 
266 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1813  alpha/beta fold family hydrolase  20.31 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0124402  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  20.73 
 
 
264 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1953  alpha/beta fold family hydrolase  20.31 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00974943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1989  hydrolase, alpha/beta fold family  20.31 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1399299999999999e-49 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1380  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 
268 aa  53.9  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  26.6 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2038  alpha/beta fold family hydrolase  20.31 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0252314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1788  alpha/beta fold family hydrolase  20.31 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000383201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2060  hydrolase, alpha/beta fold family  19.92 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000582824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  23.13 
 
 
282 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  23.69 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  17.74 
 
 
277 aa  53.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  24.32 
 
 
261 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  33.94 
 
 
296 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1770  alpha/beta fold family hydrolase  20.31 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.841886  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0770  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  24.11 
 
 
350 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
314 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 
263 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0429  alpha/beta fold family hydrolase  20.9 
 
 
279 aa  52.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
270 aa  52.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  22.9 
 
 
247 aa  52.4  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
340 aa  52.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  23.9 
 
 
309 aa  52.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1822  alpha/beta hydrolase fold  19.92 
 
 
254 aa  52  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.230718  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 
290 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  25.27 
 
 
265 aa  52  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  22.74 
 
 
352 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 
281 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0870  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 
340 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
279 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  28.34 
 
 
251 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  22.76 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2105  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0768  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  22.03 
 
 
309 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 
303 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>