More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2699 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  72.66 
 
 		 530 aa  788    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  65.65 
 
 		 532 aa  690    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  100 
 
 		 527 aa  1057    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  66.09 
 
 		 536 aa  733    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  69.77 
 
 		 529 aa  739    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  57.31 
 
 		 528 aa  598  1e-170  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  51.42 
 
 		 555 aa  544  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  51.43 
 
 		 542 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  52.68 
 
 		 551 aa  540  9.999999999999999e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  51.7 
 
 		 543 aa  532  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  52.14 
 
 		 543 aa  520  1e-146  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  51.92 
 
 		 539 aa  518  1e-146  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  51.46 
 
 		 542 aa  519  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  51.46 
 
 		 542 aa  520  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  51.46 
 
 		 545 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  48.94 
 
 		 560 aa  512  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  51.43 
 
 		 551 aa  509  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  48.67 
 
 		 543 aa  511  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  49.24 
 
 		 543 aa  499  1e-140  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  50.29 
 
 		 552 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  48.76 
 
 		 551 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  49.81 
 
 		 552 aa  488  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  47.6 
 
 		 570 aa  486  1e-136  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  47.88 
 
 		 553 aa  488  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  49.81 
 
 		 553 aa  487  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  46.44 
 
 		 557 aa  483  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  48.77 
 
 		 547 aa  483  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  48.17 
 
 		 558 aa  484  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  45.66 
 
 		 563 aa  479  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  46.63 
 
 		 559 aa  476  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  45.37 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  47.59 
 
 		 558 aa  466  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  47.28 
 
 		 541 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  45.37 
 
 		 554 aa  463  1e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  44.98 
 
 		 552 aa  462  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  49.06 
 
 		 500 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  44.44 
 
 		 557 aa  456  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  43.93 
 
 		 554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  46.45 
 
 		 548 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  44.59 
 
 		 553 aa  455  1.0000000000000001e-126  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  43.3 
 
 		 540 aa  449  1e-125  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  45.25 
 
 		 559 aa  442  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  47.41 
 
 		 549 aa  444  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  44.12 
 
 		 561 aa  441  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  46.64 
 
 		 554 aa  441  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  42.31 
 
 		 547 aa  438  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  46.64 
 
 		 550 aa  438  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.49 
 
 		 537 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  43.58 
 
 		 562 aa  425  1e-118  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  43.91 
 
 		 554 aa  421  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  43.44 
 
 		 558 aa  417  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  42.55 
 
 		 560 aa  412  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.8 
 
 		 555 aa  414  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  41.71 
 
 		 558 aa  410  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  42.77 
 
 		 548 aa  410  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  43.13 
 
 		 553 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.38 
 
 		 525 aa  389  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.76 
 
 		 528 aa  381  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.39 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.15 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.3 
 
 		 525 aa  364  3e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  36.36 
 
 		 527 aa  343  5e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  37.64 
 
 		 538 aa  342  1e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  36.77 
 
 		 535 aa  340  4e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  37.64 
 
 		 529 aa  338  9.999999999999999e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  36.19 
 
 		 527 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  36.43 
 
 		 535 aa  330  3e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  33.64 
 
 		 567 aa  320  3e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  36.04 
 
 		 541 aa  317  3e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  34.47 
 
 		 550 aa  313  2.9999999999999996e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  35.11 
 
 		 553 aa  312  7.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  35.11 
 
 		 553 aa  312  7.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  35.03 
 
 		 536 aa  312  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  35.1 
 
 		 548 aa  312  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  35.46 
 
 		 542 aa  311  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  34.3 
 
 		 533 aa  306  9.000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  33.94 
 
 		 559 aa  303  5.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  33.59 
 
 		 558 aa  301  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  35.88 
 
 		 548 aa  298  1e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  34.02 
 
 		 553 aa  294  3e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  32.57 
 
 		 536 aa  286  5e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  32.28 
 
 		 568 aa  279  9e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  33.84 
 
 		 551 aa  276  6e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  32.7 
 
 		 542 aa  271  2.9999999999999997e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  31.87 
 
 		 560 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  30.34 
 
 		 523 aa  265  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  31.12 
 
 		 531 aa  262  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  30.68 
 
 		 530 aa  260  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  31.49 
 
 		 570 aa  259  6e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  31.17 
 
 		 577 aa  258  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  31.45 
 
 		 527 aa  247  4.9999999999999997e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  32.22 
 
 		 552 aa  246  9e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  31.3 
 
 		 539 aa  244  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  31.06 
 
 		 558 aa  237  4e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  30.35 
 
 		 563 aa  236  6e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  32.63 
 
 		 534 aa  230  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  32.63 
 
 		 534 aa  230  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  29.85 
 
 		 526 aa  228  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2284  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.8 
 
 		 564 aa  225  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.458197  normal  0.134197 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  29.64 
 
 		 546 aa  212  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>