163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2468 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2468  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 248 aa  484  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2256  ABC-2 type transporter  70.16 
 
 		 247 aa  319  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.038902 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0022  ABC-2 type transporter  42.39 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  42.44 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  42.02 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  38.71 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  37.83 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  37.23 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  35.22 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  32.22 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  31.52 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  30.98 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.07 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.21 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  28.82 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  26.06 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.9 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.29 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  26.97 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.75 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  23.22 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 270 aa  52  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.75 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  28.74 
 
 		 339 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  25.62 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  28.65 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  28.16 
 
 		 339 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  29.2 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  28.74 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  29.2 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  29.31 
 
 		 339 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.32 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  26.81 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.46 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 443 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.78 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  30.09 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.78 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  28.16 
 
 		 339 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  28.16 
 
 		 339 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 		 339 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  28.3 
 
 		 280 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.11 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 		 278 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  25.89 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  29.94 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  26.47 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 		 339 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  25.93 
 
 		 382 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 384 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  25.5 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 384 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 378 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  27.87 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  26.15 
 
 		 327 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0091  ABC transporter  25.48 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  27.38 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  25.93 
 
 		 381 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  28 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  30.82 
 
 		 304 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  29.23 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  26.23 
 
 		 267 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 255 aa  45.8  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>