66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1863 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1863  flagellar accessory protein FlaH  100 
 
 
244 aa  496  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1343  flagellar accessory protein FlaH  78.28 
 
 
244 aa  409  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0124869  normal  0.27777 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0950  flagellar accessory protein FlaH  75.95 
 
 
247 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0103  flagellar accessory protein FlaH  66.53 
 
 
256 aa  333  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0351  flagellar accessory protein FlaH  57.51 
 
 
238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1966  flagellar accessory protein FlaH  42.98 
 
 
262 aa  197  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0129  flagellar accessory protein FlaH  37.12 
 
 
234 aa  154  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1326  flagellar accessory protein FlaH  33.19 
 
 
227 aa  143  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0186854  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1573  ATPase  30.28 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1319  AAA ATPase  29.09 
 
 
229 aa  85.1  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0347852  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0231  flagella-related protein H  25 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0998  flagellar accessory protein FlaH  26.46 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.753436  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1733  flagellar accessory protein FlaH  26.09 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0947  flagellar accessory protein FlaH  26.01 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.316996  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2873  AAA ATPase  23.63 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.859778  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2567  AAA ATPase  23.17 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3413  ATPase involved in biogenesis of flagella-like protein  22.59 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0974  flagellar accessory protein FlaH  26.01 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.281333  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0959  flagella-related protein H  22.69 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0266  flagellar accessory protein FlaH  29.56 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.381064  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  25.21 
 
 
504 aa  62  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  23.84 
 
 
510 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  24.57 
 
 
514 aa  52.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  24.06 
 
 
510 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  24.15 
 
 
506 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  23.53 
 
 
494 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  30.86 
 
 
267 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  29.01 
 
 
562 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  24.31 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  23.87 
 
 
507 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  23.87 
 
 
507 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  25.43 
 
 
492 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.56 
 
 
480 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  22.02 
 
 
482 aa  48.9  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  28.8 
 
 
501 aa  48.9  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  23.41 
 
 
474 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  30.77 
 
 
271 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  26.09 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  25.42 
 
 
509 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  24.02 
 
 
519 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  24.17 
 
 
575 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  25.62 
 
 
498 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  28.95 
 
 
277 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  31.33 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  24.88 
 
 
518 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  24.69 
 
 
512 aa  45.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  32.89 
 
 
262 aa  45.8  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  23.55 
 
 
512 aa  45.4  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  34.21 
 
 
496 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  27.56 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  28.95 
 
 
267 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  23.81 
 
 
481 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  23.65 
 
 
479 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  25 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  25 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  20.77 
 
 
484 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  26.32 
 
 
482 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  25.38 
 
 
301 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  26.19 
 
 
480 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.76 
 
 
498 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  24.15 
 
 
344 aa  42.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0879  KaiC  24.85 
 
 
239 aa  42.4  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  24.71 
 
 
483 aa  42  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  24.84 
 
 
232 aa  42  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  21.88 
 
 
492 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>