273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6600 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 302 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  46.45 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  41.2 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  37.54 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  39.93 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  38.54 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  40.13 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  39.05 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  39.05 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  40 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  40.82 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.05 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  32.13 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.62 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.06 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.54 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  30.66 
 
 		 320 aa  92.8  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  29.2 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  34.04 
 
 		 281 aa  92.4  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  32.5 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  30.47 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  28.51 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  35.04 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  29.49 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  32.88 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  29.64 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  28.1 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  33.53 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  31.55 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  31.55 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  28.38 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  35.29 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.91 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  29 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  32.05 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  29.95 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.47 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  28.81 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  29.69 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.95 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  29.95 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  31.02 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  25.93 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4073  hypothetical protein  29.95 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  25.93 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  29.74 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  32.37 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  32.37 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  31.02 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  29.68 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  32.32 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  31.82 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  29.89 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2483  hypothetical protein  29.59 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.941945  normal  0.050629 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  29.31 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  23.59 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  31.75 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  31.3 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  29.03 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  29.49 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  28.62 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  33.06 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  29.49 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  31.35 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  31.82 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  30.32 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  28.57 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.98 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  30.81 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  27.96 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  29.6 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  29.03 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  25.7 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  27.89 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  28.7 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  29.07 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  27.34 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  27.9 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  30.3 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  28.81 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  30.64 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  28.5 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  27.89 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  29.21 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  30.65 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  26.95 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  30.53 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  31.36 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  29.67 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  27.64 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  29.7 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  29.96 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  31.28 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>