134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2900 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 300 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  80 
 
 		 299 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  41.99 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  42.61 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.56 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  38.3 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  38.06 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  41 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  31.58 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.14 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  30.85 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  43.25 
 
 		 311 aa  118  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.81 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.27 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  27.7 
 
 		 281 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  30.79 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  26.92 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  32.12 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  25.84 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  26.48 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.9 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  28.47 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  28.52 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  22.64 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  24.65 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.45 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  25.25 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  31.35 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0513  hypothetical protein  29.45 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0514  hypothetical protein  30.66 
 
 		 141 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1472  DMT family permease  26.54 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00237302  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  30.04 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  33.22 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  27.5 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  27.96 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  29.84 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  24.58 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  31.75 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  30.9 
 
 		 296 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  24.91 
 
 		 297 aa  52.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  29.9 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  29.08 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.02 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.65 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  29.69 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  31.73 
 
 		 365 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  31.6 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  31.46 
 
 		 311 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  28.68 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  30.08 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  26.86 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  26.52 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  29.31 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  27.97 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  26.92 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  26.22 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.49 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  26.05 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  25.67 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  28.52 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  28.37 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  26.05 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  26.05 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  20.38 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  29.39 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  29.79 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.28 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.44 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  20.23 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  27.97 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.29 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  28.73 
 
 		 293 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0897  hypothetical protein  29.21 
 
 		 278 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.631213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  29.62 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 330 aa  45.8  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  26.6 
 
 		 300 aa  45.8  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  25.29 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  27 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3809  integral membrane protein  24.06 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.770617  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  23.68 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  27.43 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  27 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  27.05 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>