More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1460 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 433 aa  858    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  69.46 
 
 		 435 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  67.94 
 
 		 441 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  52.51 
 
 		 443 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  50.64 
 
 		 430 aa  388  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  49.62 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  51.02 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  48.61 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 		 444 aa  382  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  46.97 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  47.22 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  45.01 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  49.13 
 
 		 432 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  47.41 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  46.47 
 
 		 440 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 439 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 441 aa  358  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.71 
 
 		 439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  44.28 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 442 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 		 439 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  46.92 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 436 aa  352  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  49.02 
 
 		 445 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  44.77 
 
 		 440 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  48.61 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  46.72 
 
 		 432 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 		 444 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 		 440 aa  350  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 434 aa  349  7e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 434 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  41.33 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 439 aa  346  4e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 441 aa  346  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  45.02 
 
 		 442 aa  346  6e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  42.72 
 
 		 469 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  44.79 
 
 		 444 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.72 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  42.72 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  45.64 
 
 		 449 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  42.72 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  42.72 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  42.72 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  42.47 
 
 		 469 aa  343  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 434 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 434 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 434 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 441 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  44.3 
 
 		 437 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.08 
 
 		 441 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 440 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  42.08 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 441 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 441 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  39.87 
 
 		 452 aa  338  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 441 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  40.7 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  41.32 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  42.24 
 
 		 433 aa  337  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 445 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 428 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 434 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  42.24 
 
 		 433 aa  336  5e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 454 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 445 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  43.31 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 448 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 448 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 440 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 448 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 440 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0200  major facilitator family transporter  42.29 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 434 aa  332  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  45.17 
 
 		 456 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 452 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 428 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  44.65 
 
 		 435 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 436 aa  332  8e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 436 aa  332  8e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  43.47 
 
 		 441 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  43.47 
 
 		 441 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  39.29 
 
 		 441 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 440 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  40.93 
 
 		 440 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 450 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2646  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 		 453 aa  330  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 459 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>