139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3414 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3414  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  100 
 
 		 213 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4288  heme exporter protein CcmB  47.8 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3728  heme exporter protein CcmB  47.32 
 
 		 228 aa  174  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77019  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0230  heme exporter protein CcmB  47.8 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101455  unclonable  0.0000000000289214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0225  heme exporter protein CcmB  47.8 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.933912  hitchhiker  0.0051729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0230  heme exporter protein CcmB  47.8 
 
 		 228 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051216  unclonable  0.0000000000381646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0262  heme exporter protein CcmB  47.8 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4025  heme exporter protein CcmB  47.32 
 
 		 228 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0197345  hitchhiker  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0227  heme exporter protein CcmB  47.32 
 
 		 228 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00899447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0227  heme exporter protein CcmB  47.32 
 
 		 228 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00610069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0230  heme exporter protein CcmB  47.32 
 
 		 228 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288437  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4660  heme exporter protein CcmB  48.29 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0214  heme exporter protein CcmB  47.32 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0244  heme exporter protein CcmB  45.37 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00742888  hitchhiker  0.00325312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0189  heme exporter protein CcmB  46.83 
 
 		 228 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173434  hitchhiker  0.00165227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3570  heme exporter protein CcmB  44.13 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0688064  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0178  heme exporter protein CcmB  45.85 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3390  heme exporter protein CcmB  44.81 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1959  heme exporter protein CcmB  42.45 
 
 		 241 aa  151  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1517  heme exporter protein CcmB  40.98 
 
 		 206 aa  151  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03134  hypothetical protein  45.28 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002842  ABC transporter involved in cytochrome c biogenesis CcmB subunit  44.81 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1867  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  40.87 
 
 		 239 aa  148  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2280  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  45.28 
 
 		 222 aa  141  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3992  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  44.78 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4208  heme exporter protein CcmB  40.76 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2596  heme exporter protein CcmB  40.76 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3255  heme exporter protein CcmB  41.75 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4101  heme exporter protein CcmB  40.28 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2437  heme exporter protein CcmB  40.28 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.632911 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1382  heme exporter protein CcmB  41.04 
 
 		 221 aa  138  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.691654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06063  heme exporter protein CcmB  36.32 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101689  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00864  heme exporter protein CcmB  36.32 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257235  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1644  heme exporter protein B  46.23 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1216  heme exporter protein CcmB  44.34 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3023  heme exporter protein CcmB  44.66 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2388  heme exporter protein CcmB  40.28 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4046  heme exporter protein CcmB  40.28 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02127  heme exporter subunit  43.13 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1459  heme exporter protein CcmB  43.13 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02086  hypothetical protein  43.13 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0741  heme exporter protein CcmB  43.13 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.756064  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1365  heme exporter protein CcmB  39.22 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3337  heme exporter protein CcmB  43.13 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2338  heme exporter protein CcmB  43.13 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2499  heme exporter protein CcmB  43.13 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1450  heme exporter protein CcmB  43.13 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2348  heme exporter protein CcmB  43.13 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4150  heme exporter protein CcmB  39.81 
 
 		 218 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2493  heme exporter protein CcmB  39.81 
 
 		 218 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437502 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2479  heme exporter protein CcmB  39.81 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4029  heme exporter protein CcmB  39.81 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1545  heme exporter protein CcmB  40.91 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.328783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1033  heme exporter protein CcmB  45.75 
 
 		 271 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0039  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  40.98 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.46619  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0953  heme exporter protein CcmB  47.03 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5769  heme exporter protein CcmB  36.6 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2442  heme exporter protein CcmB  37.09 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03073  ABC type heme exporter, permease subunit ccmB  42.31 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2112  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  35.59 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4059  cytochrome c heme exporter protein  38.94 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2848  heme exporter protein CcmB  38.35 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1828  ABC exporter, inner membrane subunit CcmB  35.14 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2386  heme exporter protein CcmB  38 
 
 		 228 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000961285  hitchhiker  0.0000188714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0293  heme exporter protein CcmB  37.24 
 
 		 222 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0327308 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0394  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein B)  39.62 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1388  heme exporter protein CcmB  45.28 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0394  heme exporter protein B  45.28 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1497  heme exporter protein CcmB  45.28 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3634  heme exporter protein CcmB  41.31 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1285  heme exporter protein CcmB  34.07 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.583971  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0206  heme exporter protein CcmB  35.24 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0588  heme exporter protein CcmB  42.7 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0176  heme exporter protein CcmB  36.08 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3662  heme exporter protein CcmB  35.2 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  hitchhiker  0.00482221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2859  heme exporter protein CcmB  34.02 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2165  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  35.07 
 
 		 236 aa  112  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2634  heme exporter protein CcmB  34.02 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2727  heme exporter protein CcmB  43.87 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0380  heme ABC transporter (heme exporter protein B), permease protein (cytochrome c biogenesis)  38.42 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969313 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4767  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  39.23 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3359  heme exporter protein CcmB  37.24 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2423  heme exporter protein CcmB  43.87 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0410  heme exporter protein CcmB  38.31 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1684  heme exporter protein CcmB  39.33 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0201  heme exporter protein CcmB  39.05 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0321  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  37.93 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1578  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  42.92 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0523  heme exporter protein CcmB  37.37 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1405  heme exporter protein CcmB  45.1 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1214  ABC transporter permease  35.57 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0044  heme exporter protein CcmB  38.54 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1000  heme exporter protein CcmB  33.51 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3854  heme exporter protein CcmB  36.61 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1179  heme exporter protein CcmB  39.38 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45370  heme exporter protein CcmB  44.66 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3507  heme exporter protein CcmB  38.69 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00483881 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0371  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  33.02 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000646849 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0947  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  43.96 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30440  Cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  42.45 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>