More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2440 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2440  ABC transporter related  100 
 
 
211 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0587803  normal  0.683858 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3276  ABC transporter related  46.41 
 
 
227 aa  181  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2961  ABC transporter related  46.12 
 
 
226 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4044  ABC transporter related  46.63 
 
 
213 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1271  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.36 
 
 
220 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.481106  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1444  ABC transporter related  47.8 
 
 
219 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3224  ABC transporter related  46.28 
 
 
224 aa  170  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2504  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.78 
 
 
197 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0974  ABC transporter related  44.17 
 
 
208 aa  168  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0234767 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02680  hypothetical protein  45.86 
 
 
215 aa  168  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003795  ABC transporter ATP-binding protein YnjD  44.86 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.260777  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2770  ABC transporter ATP-binding protein  42.27 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154794  normal  0.0956097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2475  ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 
217 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2005  ABC transporter, ATP-binding protein  41.71 
 
 
217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1979  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.289049  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01725  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  42.71 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1886  ABC transporter related protein  42.71 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1876  ABC transporter related  42.71 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01713  hypothetical protein  42.71 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1840  ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1434  ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 
217 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1691  ABC transporter related  40.82 
 
 
206 aa  155  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01791  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.83 
 
 
212 aa  155  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2155  ABC transporter-related protein  44.27 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000406105 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1834  ABC transporter related  40.69 
 
 
214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1404  ABC transporter related  35.5 
 
 
356 aa  141  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0478366  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5375  ABC transporter related  37.5 
 
 
387 aa  141  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0766723  normal  0.734389 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6101  ABC transporter, ATPase subunit  40.2 
 
 
214 aa  141  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101171  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7604  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.45 
 
 
413 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  36.24 
 
 
339 aa  138  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5129  ABC transporter related  36.5 
 
 
370 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701996  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  39.27 
 
 
373 aa  138  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0845  ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 
340 aa  136  2e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0516  ABC transporter related  37.91 
 
 
216 aa  136  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  37.27 
 
 
389 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0252  ABC transporter related  36.46 
 
 
356 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  37.67 
 
 
358 aa  134  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  37.31 
 
 
387 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  37.56 
 
 
349 aa  132  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1531  ABC transporter related  35.44 
 
 
211 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.952965  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  36.45 
 
 
353 aa  132  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  38.07 
 
 
353 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  37.93 
 
 
377 aa  132  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  37.89 
 
 
393 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6133  ABC transporter related  38.68 
 
 
351 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.315029 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  38.68 
 
 
351 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  36.32 
 
 
359 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.82 
 
 
327 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05528  arginine transporter ATP-binding subunit  37.96 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
327 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  36.82 
 
 
363 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
327 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04080  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  37.11 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  35.75 
 
 
357 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  36.32 
 
 
337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2253  ABC transporter related  43.98 
 
 
211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663357  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
327 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0053  ABC transporter related  34.13 
 
 
309 aa  129  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.916211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
331 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
331 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.89 
 
 
393 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  36 
 
 
342 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
327 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 
354 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
327 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2333  ABC transporter related protein  37.3 
 
 
361 aa  129  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  36.18 
 
 
346 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  38.31 
 
 
357 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.82 
 
 
327 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1642  ABC-type sugar transport system, ATPase component  37.1 
 
 
361 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174606  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 
331 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 
331 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  37 
 
 
370 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0153  ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 
257 aa  128  6e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.504162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1807  ABC transporter related  39.79 
 
 
367 aa  128  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0324794  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0243  ABC transporter  35.53 
 
 
340 aa  128  7.000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  36.95 
 
 
355 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1326  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.86 
 
 
224 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00202855  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 
356 aa  127  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  35.55 
 
 
356 aa  127  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  35.55 
 
 
356 aa  127  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  35.29 
 
 
374 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.37 
 
 
395 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.75 
 
 
338 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  35.71 
 
 
348 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  35.5 
 
 
364 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  36.45 
 
 
355 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1533  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.86 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0016393  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  36.76 
 
 
347 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00164  putative ABC-type transport system, ATPase component  35.03 
 
 
344 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.48 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  35.71 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  36.14 
 
 
389 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1227  ABC transporter related  34 
 
 
379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000640126 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.03 
 
 
349 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  34.47 
 
 
357 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  36.79 
 
 
349 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  36.7 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  35.82 
 
 
527 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001572  arginine ABC transporter ATP-binding protein ArtP  36.57 
 
 
242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>