More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1325 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 425 aa  848    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  33.81 
 
 		 420 aa  229  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  34.56 
 
 		 420 aa  229  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  33.91 
 
 		 440 aa  220  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  34.52 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  34.99 
 
 		 483 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  34.52 
 
 		 418 aa  206  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  34.52 
 
 		 418 aa  206  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  34.52 
 
 		 418 aa  206  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  33.08 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  34.52 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  34.52 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  34.52 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  34.52 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  33.74 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  32.49 
 
 		 417 aa  199  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  31.41 
 
 		 416 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  31.41 
 
 		 416 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  31.41 
 
 		 416 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  35.77 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  32.35 
 
 		 417 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  33.08 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  30.94 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  30.47 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  31.73 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  28.68 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  29.44 
 
 		 418 aa  167  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  27.02 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  27.79 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  27.79 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  27.79 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  27.79 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  26.55 
 
 		 422 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  26.18 
 
 		 422 aa  163  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  30.91 
 
 		 421 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  26.55 
 
 		 422 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  26.3 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4689  inner membrane protein YjeH  29.25 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4746  inner membrane protein YjeH  29.25 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.733754  normal  0.566679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4725  inner membrane protein YjeH  29.25 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.201688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4606  inner membrane protein YjeH  29.25 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4598  inner membrane protein YjeH  29.25 
 
 		 420 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  29 
 
 		 430 aa  156  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  26.97 
 
 		 422 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 431 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  25.93 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  25.93 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  25.47 
 
 		 426 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 425 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  25.83 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  25.97 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  25.97 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  25.97 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  25.97 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  25.73 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  25.73 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  24.37 
 
 		 428 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  24.52 
 
 		 431 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  24.45 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  24.63 
 
 		 428 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  24.63 
 
 		 428 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  24.45 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3197  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  25.51 
 
 		 475 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 716 aa  100  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 429 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 		 442 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  25.42 
 
 		 411 aa  97.1  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  23.82 
 
 		 434 aa  96.3  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26 
 
 		 770 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  29.96 
 
 		 745 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 786 aa  90.5  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  25.29 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1067  putrescine transporter  25.15 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2657  lysine/cadaverine antiporter  23.96 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  25.52 
 
 		 450 aa  87.8  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 445 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 445 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 445 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3457  amino acid permease-associated region  23.65 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.553768  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2580  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1807  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00206  lysine/cadaverine antiporter  23.72 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002188  lysine/cadaverine antiporter membrane protein CadB  23.45 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000189693  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  26.13 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4417  amino acid permease-associated region  28.89 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  26.13 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  26.13 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  26.13 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  25.88 
 
 		 445 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1006  lysine/cadaverine antiporter  25.29 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000705878  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2492  lysine/cadaverine antiporter  24.53 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001093  putrescine/proton symporter putrescine/ornithine antiporter PotE  23.85 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1458  amino acid permease-associated region  23.36 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>