More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4475 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4475  cold-shock DNA-binding protein family protein  100 
 
 
147 aa  295  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.534449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4562  cold-shock DNA-binding protein family protein  99.26 
 
 
136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0340056 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4858  cold-shock DNA-binding protein family protein  99.26 
 
 
136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705438  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5045  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  89.71 
 
 
136 aa  250  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1707  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  86.03 
 
 
136 aa  243  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1236  Cold-shock protein DNA-binding protein  77.14 
 
 
155 aa  223  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10888  cold shock protein B cspB  77.94 
 
 
138 aa  220  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73128e-16  normal  0.272066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0825  cold-shock DNA-binding domain protein  60.43 
 
 
139 aa  176  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.425934  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34040  cold-shock DNA-binding protein family  61.48 
 
 
128 aa  169  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0481  cold-shock DNA-binding domain protein  60.74 
 
 
131 aa  166  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4731  cold-shock DNA-binding domain protein  56.52 
 
 
129 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4426  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.52 
 
 
131 aa  153  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.285968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5860  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.7 
 
 
144 aa  151  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0146  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.41 
 
 
132 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4338  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.11 
 
 
128 aa  147  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3947  cold-shock protein, DNA-binding  50.37 
 
 
128 aa  146  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.986356  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0104  cold-shock DNA-binding protein family protein  54.07 
 
 
129 aa  140  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3932  cold-shock DNA-binding protein family protein  53.33 
 
 
131 aa  140  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8902  putative cold-shock DNA-binding domain protein  52.21 
 
 
132 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197613  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0812  cold-shock DNA-binding domain protein  55.56 
 
 
131 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31390  cold-shock DNA-binding protein family  46.32 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.5492  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26200  cold-shock DNA-binding protein family  48.91 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0818  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 
135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0234  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.19 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0790  cold-shock DNA-binding protein family protein  49.26 
 
 
127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3580  putative cold-shock DNA-binding domain protein  47.06 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0321058  normal  0.113438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0848  cold-shock DNA-binding domain protein  46.32 
 
 
127 aa  124  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.433224  decreased coverage  0.00674689 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0746  cold-shock DNA-binding domain protein  46.32 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0633058  hitchhiker  0.00940381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0908  cold-shock DNA-binding domain protein  45.93 
 
 
127 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.547384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3294  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
131 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977708  normal  0.173304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8097  cold-shock DNA-binding domain protein  43.8 
 
 
131 aa  120  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4185  cold-shock DNA-binding domain protein  44.85 
 
 
127 aa  120  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.942545  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04160  cold-shock DNA-binding protein family  47.06 
 
 
127 aa  120  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0300603  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2047  cold-shock DNA-binding domain protein  43.38 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24110  cold-shock DNA-binding protein family  41.91 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2930  cold-shock DNA-binding domain protein  42.65 
 
 
127 aa  114  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.915487  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0007  cold shock protein  41.48 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0722  cold-shock DNA-binding domain protein  40.74 
 
 
129 aa  105  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.155583 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  52.38 
 
 
66 aa  73.9  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  54.1 
 
 
67 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  54.1 
 
 
67 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  54.1 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  54.1 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  54.1 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.1 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  52.46 
 
 
65 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  54.1 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  54.1 
 
 
65 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  54.1 
 
 
65 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  54.1 
 
 
65 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.33 
 
 
65 aa  70.5  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
66 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.88 
 
 
66 aa  69.7  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  50 
 
 
66 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.44 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0880  cold shock protein  45.31 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000035682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.17 
 
 
67 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.44 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.074349  hitchhiker  0.00762568 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  48.44 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  48.44 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.88 
 
 
68 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  48.44 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  48.44 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  48.44 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  48.44 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  48.44 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  48.44 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
66 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.88 
 
 
68 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1572  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.44 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259211  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.88 
 
 
68 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0435864  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  48.44 
 
 
66 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.44 
 
 
66 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1970  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00428125  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  53.85 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  48.44 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2787  cold shock domain-contain protein  48.44 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2407  cold-shock DNA-binding protein family protein  48.44 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0284217  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2477  cold-shock DNA-binding protein family protein  48.44 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.916903  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2569  cold-shock DNA-binding protein family protein  48.44 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.608616  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.39 
 
 
66 aa  67  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.03 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
66 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1731  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.61 
 
 
69 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000915529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1748  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.88 
 
 
69 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1705  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.88 
 
 
69 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000671273  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2659  cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
69 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00019694  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1708  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.88 
 
 
69 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000316023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  48.44 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  48.44 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2100  CSD family cold shock protein  46.03 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  48.44 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  48.44 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  48.44 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  48.44 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  48.44 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  48.44 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>