More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3078 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
145 aa  303  8.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  72.92 
 
 
146 aa  221  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  72.92 
 
 
146 aa  221  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  47.59 
 
 
147 aa  140  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  46.9 
 
 
147 aa  138  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  44.52 
 
 
147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  42.57 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  43.71 
 
 
152 aa  120  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  42.76 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  42.47 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  41.78 
 
 
145 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  43.36 
 
 
141 aa  117  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  41.1 
 
 
145 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  44.37 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  42.66 
 
 
158 aa  111  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  39.57 
 
 
144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 
156 aa  110  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  41.13 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  39.46 
 
 
148 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  40.94 
 
 
153 aa  107  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  39.29 
 
 
144 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 
158 aa  105  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  39.72 
 
 
143 aa  104  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 
147 aa  105  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
163 aa  103  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 
147 aa  103  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
147 aa  103  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  45.13 
 
 
139 aa  103  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
147 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  33.77 
 
 
151 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  36.57 
 
 
144 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
139 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  36.67 
 
 
151 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  39.1 
 
 
139 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.67 
 
 
151 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 
144 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
137 aa  100  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 
142 aa  100  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
147 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  42.48 
 
 
139 aa  100  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
148 aa  99  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  44.72 
 
 
132 aa  99  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  35.1 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  46.9 
 
 
134 aa  97.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  44.26 
 
 
134 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
162 aa  97.8  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  37.86 
 
 
158 aa  97.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  39.73 
 
 
146 aa  97.1  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  42.72 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 
145 aa  96.7  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 
160 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  35.86 
 
 
160 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  41.18 
 
 
162 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  44.25 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  38.69 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 
147 aa  94  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
143 aa  94  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  40.2 
 
 
162 aa  93.6  7e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 
195 aa  93.6  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0756  heat shock protein Hsp20  44.27 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  36.24 
 
 
150 aa  92  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
143 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  45.95 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
142 aa  90.5  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  40.71 
 
 
139 aa  90.5  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
136 aa  90.5  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  37.67 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  41.8 
 
 
132 aa  90.5  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  35.95 
 
 
176 aa  90.1  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  36.88 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
151 aa  90.1  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  35.37 
 
 
145 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 
189 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 
156 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
149 aa  88.6  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  35.37 
 
 
145 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  39.81 
 
 
167 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  36.15 
 
 
152 aa  88.2  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
158 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  36.31 
 
 
204 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  31.91 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  30.5 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 
194 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>