74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2716 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  616  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  95.64 
 
 		 298 aa  590  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  93.24 
 
 		 301 aa  578  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  51.81 
 
 		 295 aa  324  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  52.17 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  51.59 
 
 		 290 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  53.05 
 
 		 289 aa  316  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  50.36 
 
 		 302 aa  313  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  48.55 
 
 		 282 aa  295  6e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  47.54 
 
 		 285 aa  281  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  49.31 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  48.24 
 
 		 287 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  47.18 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  43.68 
 
 		 300 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  43.68 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  43.68 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  40.91 
 
 		 283 aa  245  6e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  41.88 
 
 		 283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  42.16 
 
 		 301 aa  241  9e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  42.86 
 
 		 276 aa  231  9e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  37.59 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  37.85 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  40.08 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  35.51 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  37.24 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  34.6 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  35.17 
 
 		 291 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  33.45 
 
 		 298 aa  169  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  37.05 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  35.25 
 
 		 284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  35.51 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  32.86 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  34.4 
 
 		 326 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  35.74 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  32.37 
 
 		 287 aa  152  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  30.27 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  30.34 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  34.35 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  31.93 
 
 		 294 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  35.66 
 
 		 288 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  31.49 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  35.34 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  30.29 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  28.36 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  30.56 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  33.1 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  31.91 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  31.13 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  31.94 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  32.16 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  31.87 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  32.83 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  31.4 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  31.37 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  29.96 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  30.95 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  31.98 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  28.95 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  35.04 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  22.35 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_30  hypothetical protein  33.77 
 
 		 96 aa  52.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.12 
 
 		 230 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  33.77 
 
 		 699 aa  48.9  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  49.3  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  32.41 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  35.21 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.88 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0108  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.85 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403778 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.58 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2885  transcriptional regulator protein-like protein  29.21 
 
 		 329 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379735  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  26.26 
 
 		 322 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.74 
 
 		 312 aa  42.7  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>