131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1249 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  100 
 
 		 444 aa  915    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  81.61 
 
 		 452 aa  748    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  80.92 
 
 		 448 aa  744    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  81.61 
 
 		 452 aa  748    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  81.61 
 
 		 452 aa  748    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  80.92 
 
 		 448 aa  744    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  98.65 
 
 		 444 aa  905    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  65.44 
 
 		 463 aa  568  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.45 
 
 		 425 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  42.59 
 
 		 421 aa  306  7e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  38.34 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  41.2 
 
 		 411 aa  292  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.04 
 
 		 421 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.27 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  35.31 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  35.04 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  32.72 
 
 		 409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  33.41 
 
 		 408 aa  220  5e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  36.14 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  38.92 
 
 		 684 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  31.58 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  33.26 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  31.96 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.16 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.31 
 
 		 488 aa  199  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  31.35 
 
 		 411 aa  199  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.92 
 
 		 413 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  51.26 
 
 		 222 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  51.4 
 
 		 471 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.43 
 
 		 483 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  32.54 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  54.59 
 
 		 447 aa  177  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  66.41 
 
 		 247 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  28.95 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  50.54 
 
 		 441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  27.73 
 
 		 396 aa  163  7e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  50 
 
 		 203 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  54.07 
 
 		 183 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  52.14 
 
 		 178 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  48.7 
 
 		 196 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  49.66 
 
 		 200 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  47.69 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.86 
 
 		 403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  52.29 
 
 		 177 aa  117  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  42.75 
 
 		 184 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  44.03 
 
 		 212 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  33.5 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  45.8 
 
 		 459 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  43.85 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  52.33 
 
 		 87 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  53.85 
 
 		 131 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  38.97 
 
 		 196 aa  88.6  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  54.55 
 
 		 77 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  37.59 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  39.51 
 
 		 94 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  39.51 
 
 		 94 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.7 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3718  ParB domain protein nuclease  31.3 
 
 		 223 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.46 
 
 		 225 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1149  ParB domain protein nuclease  34.88 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.6 
 
 		 259 aa  51.2  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.4 
 
 		 226 aa  50.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  27.15 
 
 		 304 aa  50.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  23.08 
 
 		 285 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  28.97 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  36.59 
 
 		 270 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.88 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.83 
 
 		 258 aa  48.9  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1156  ParB domain protein nuclease  29.67 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.28535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  37.84 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.6 
 
 		 359 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.66 
 
 		 273 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  34.41 
 
 		 294 aa  47.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.51 
 
 		 266 aa  47.8  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0563  ParB domain protein nuclease  28.57 
 
 		 462 aa  47.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0951  DNA methylase  31.18 
 
 		 250 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248697  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  24.34 
 
 		 311 aa  47.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3104  ParB domain protein nuclease  28.57 
 
 		 457 aa  47.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.31 
 
 		 286 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.31 
 
 		 286 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.71 
 
 		 308 aa  47  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  38.89 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.71 
 
 		 308 aa  47  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  28.7 
 
 		 290 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  28.7 
 
 		 290 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  28.7 
 
 		 290 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  28.7 
 
 		 290 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1200  DNA methylase N-4/N-6  29.59 
 
 		 306 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00320922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3163  parB-like partition protein  31.43 
 
 		 352 aa  46.6  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.53 
 
 		 419 aa  47  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  28.7 
 
 		 290 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  28.7 
 
 		 290 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  31.18 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2980  ParB-like chromosome partitioning protein  32.65 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  28.7 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.36 
 
 		 273 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  32.43 
 
 		 272 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  28.7 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  28.7 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>