63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0212 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  327  5.0000000000000004e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  49.02 
 
 
169 aa  147  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  45.4 
 
 
165 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  45.73 
 
 
165 aa  134  8e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  36.42 
 
 
168 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  38.1 
 
 
178 aa  100  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  31.58 
 
 
167 aa  97.1  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  34.73 
 
 
163 aa  96.3  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  36.11 
 
 
168 aa  95.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  42.86 
 
 
168 aa  92.8  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  40.34 
 
 
165 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  35.37 
 
 
171 aa  91.3  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  37.5 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  36.31 
 
 
171 aa  87  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  34.51 
 
 
165 aa  84.3  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  35.83 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  30.2 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  34.56 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  34.25 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  42.55 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  30.63 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  36.72 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  37.63 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  34.93 
 
 
196 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  27.94 
 
 
174 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  32.54 
 
 
167 aa  60.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  31.16 
 
 
181 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  25.42 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  35.25 
 
 
149 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  28.03 
 
 
180 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  30.71 
 
 
160 aa  52  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  29.6 
 
 
180 aa  50.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  38.16 
 
 
143 aa  50.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  31.36 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  34.91 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  29.79 
 
 
207 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  41.03 
 
 
166 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  31.33 
 
 
172 aa  47.4  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  34.34 
 
 
178 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  34.43 
 
 
151 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  28.46 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  29.17 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  28.47 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  31.78 
 
 
141 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  32.28 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  31.14 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  26.36 
 
 
139 aa  44.7  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  32.5 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  32.56 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  28.83 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  29.13 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  26.8 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  30.53 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  29.32 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  30.15 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 
125 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  30.28 
 
 
147 aa  41.2  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  29.55 
 
 
152 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  27.96 
 
 
121 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  31.48 
 
 
134 aa  40.8  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  29.03 
 
 
135 aa  40.8  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>