More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0542 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
264 aa  546  1e-155  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  97.73 
 
 
264 aa  540  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  95.08 
 
 
264 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  82.2 
 
 
264 aa  473  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0222  stationary phase survival protein SurE  71.43 
 
 
242 aa  354  8.999999999999999e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  47.76 
 
 
267 aa  236  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  49.21 
 
 
261 aa  230  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  47.43 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  46.77 
 
 
260 aa  217  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  46.42 
 
 
263 aa  208  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  45.6 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  45.82 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  43.85 
 
 
263 aa  187  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  40.15 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  38.87 
 
 
265 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 
255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  38.11 
 
 
255 aa  162  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
262 aa  161  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  38.65 
 
 
247 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  38.02 
 
 
277 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 
255 aa  156  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  40.31 
 
 
259 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  36.78 
 
 
257 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  39.06 
 
 
259 aa  152  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  36.19 
 
 
258 aa  152  4e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 
250 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 
251 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 
254 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  36.19 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 
248 aa  152  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 
264 aa  151  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  35.45 
 
 
264 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  35.23 
 
 
256 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  40.48 
 
 
257 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  35.97 
 
 
258 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  36.09 
 
 
248 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  38.25 
 
 
255 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  36.98 
 
 
252 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  36.25 
 
 
252 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  35.19 
 
 
263 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  39.29 
 
 
254 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  36.74 
 
 
258 aa  148  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 
260 aa  148  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  36.86 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  36.19 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  36.54 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  35.47 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  38.93 
 
 
265 aa  146  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  35.5 
 
 
257 aa  145  5e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 
254 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  35.4 
 
 
258 aa  145  6e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  37.26 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 
254 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  37.02 
 
 
265 aa  145  9e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  37.74 
 
 
266 aa  145  9e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  36.22 
 
 
258 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  34.8 
 
 
257 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  34.9 
 
 
270 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  36.15 
 
 
253 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  36.8 
 
 
256 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  37.15 
 
 
269 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  34.8 
 
 
257 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  38.85 
 
 
255 aa  143  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  37.55 
 
 
245 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  35.69 
 
 
258 aa  142  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  34.8 
 
 
250 aa  142  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  34.25 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  34.57 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  35.2 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  35.29 
 
 
266 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 
249 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  35.23 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3500  stationary-phase survival protein SurE  37.5 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  34.51 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  33.97 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  33.97 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  35.57 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  36.09 
 
 
252 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  37.45 
 
 
257 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  35.16 
 
 
255 aa  138  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  38.04 
 
 
251 aa  139  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  34.85 
 
 
259 aa  138  8.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  36.65 
 
 
263 aa  138  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  34.56 
 
 
256 aa  138  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  36.8 
 
 
265 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  34.13 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  34.4 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  36.4 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  37.11 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  36.4 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_703  stationary-phase survival protein  37.13 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000177307  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 
264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  36.4 
 
 
279 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  34.87 
 
 
247 aa  135  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>