More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1549 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1549  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  100 
 
 
377 aa  754    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0429741  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0780  cystathionine gamma-synthase  56.53 
 
 
379 aa  358  7e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1031  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  55.44 
 
 
386 aa  349  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4330  hypothetical protein  54.74 
 
 
379 aa  342  9e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1414  cystathionine gamma-synthase  54.91 
 
 
386 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3084  Cystathionine gamma-synthase  54.6 
 
 
405 aa  341  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2858  cystathionine gamma-synthase  54.32 
 
 
405 aa  333  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687015  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2976  Cystathionine gamma-synthase  54.45 
 
 
417 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5099  cystathionine gamma-synthase  54.16 
 
 
400 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  0.26401 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1446  Cystathionine gamma-lyase  52.3 
 
 
382 aa  309  5e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.819865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  44.59 
 
 
373 aa  305  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1876  Cystathionine gamma-lyase  44.17 
 
 
371 aa  299  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  43.75 
 
 
376 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  47.57 
 
 
372 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  47.84 
 
 
380 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1002  cystathionine gamma-synthase  47.57 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.282696  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  45.21 
 
 
393 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  44.41 
 
 
387 aa  279  7e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  45.09 
 
 
392 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  45.09 
 
 
392 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  45.09 
 
 
392 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4016  cystathionine gamma-synthase  46.07 
 
 
372 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  44.12 
 
 
379 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  44.91 
 
 
389 aa  276  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  44.14 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  43.24 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  44.15 
 
 
379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  43.77 
 
 
383 aa  272  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  43.85 
 
 
388 aa  272  7e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0184  Cystathionine gamma-synthase  46.07 
 
 
378 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  44.53 
 
 
390 aa  270  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  42.71 
 
 
389 aa  269  5e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  40.65 
 
 
390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  41.27 
 
 
398 aa  267  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  41.11 
 
 
401 aa  266  5.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  41.69 
 
 
381 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  42.18 
 
 
397 aa  263  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  40.84 
 
 
386 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  41.95 
 
 
387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  40.84 
 
 
394 aa  259  6e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  43.12 
 
 
381 aa  259  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  39.84 
 
 
377 aa  258  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  40.05 
 
 
394 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  39.79 
 
 
394 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  43.16 
 
 
390 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  40.79 
 
 
380 aa  256  4e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  41.51 
 
 
394 aa  255  8e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  43.47 
 
 
392 aa  255  8e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  43.8 
 
 
383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01446  Cystathionine gamma-lyase (EC 4.4.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT6]  40.63 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.332216  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  43.39 
 
 
381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  46.15 
 
 
385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  42.23 
 
 
383 aa  253  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  40.79 
 
 
381 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  40.21 
 
 
391 aa  252  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  41.16 
 
 
387 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5069  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  45.38 
 
 
385 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  40.21 
 
 
390 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  40.68 
 
 
387 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  41.03 
 
 
386 aa  249  5e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77247  cystathionine gamma-lyase  39.38 
 
 
398 aa  249  6e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.836734  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  39.51 
 
 
378 aa  248  9e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  41.36 
 
 
390 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  39.68 
 
 
390 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  39.95 
 
 
390 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  41.01 
 
 
390 aa  247  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  40.68 
 
 
384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.21 
 
 
387 aa  246  6e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0937  Cystathionine gamma-synthase  41.35 
 
 
411 aa  246  6e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  37.87 
 
 
385 aa  245  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.68 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  39.15 
 
 
390 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  38.9 
 
 
383 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.1 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  39.37 
 
 
392 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  42.93 
 
 
380 aa  242  7e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  38.98 
 
 
388 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.1 
 
 
387 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  38.79 
 
 
402 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  40.46 
 
 
393 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.74 
 
 
390 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  40.27 
 
 
386 aa  241  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.1 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.1 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20810  cystathionine gamma-lyase  43.95 
 
 
434 aa  239  4e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  38.44 
 
 
380 aa  239  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  40 
 
 
391 aa  239  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  40.58 
 
 
393 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  38.16 
 
 
400 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  38.46 
 
 
378 aa  237  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.92 
 
 
385 aa  236  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  39.32 
 
 
388 aa  236  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  36.53 
 
 
387 aa  235  8e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  38.22 
 
 
379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4640  Cystathionine gamma-lyase  41.03 
 
 
394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  40.31 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  34.74 
 
 
392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  39.02 
 
 
379 aa  233  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  40.31 
 
 
393 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  36.01 
 
 
387 aa  233  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>