163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0895 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  99.48 
 
 
193 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2964  hypothetical protein  74.68 
 
 
233 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0815547  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  71.9 
 
 
202 aa  228  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2069  protein of unknown function DUF218  47.62 
 
 
253 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.325026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  38.79 
 
 
334 aa  97.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  37.29 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  39.06 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  39.06 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  39.06 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04767  hypothetical protein  37.5 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  30.86 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  39.66 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  32.82 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  39.66 
 
 
237 aa  68.2  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  35.58 
 
 
235 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  38.05 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  37.5 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  28.95 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  37.5 
 
 
268 aa  64.7  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  37.17 
 
 
206 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  36.69 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  36.15 
 
 
253 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  32.62 
 
 
267 aa  62  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  36.27 
 
 
280 aa  61.2  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  34.34 
 
 
273 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  40 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1032  protein of unknown function DUF218  35.4 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  31.41 
 
 
262 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  27.14 
 
 
262 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  30 
 
 
280 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  28.09 
 
 
262 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  33.06 
 
 
266 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  31.82 
 
 
265 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  33.59 
 
 
278 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  33.81 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3404  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
170 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  29.23 
 
 
280 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  31.82 
 
 
278 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2200  hypothetical protein  34.64 
 
 
252 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  29.46 
 
 
243 aa  56.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  34.21 
 
 
264 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  30 
 
 
284 aa  55.1  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  29.63 
 
 
219 aa  55.1  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  35.78 
 
 
153 aa  54.7  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  34.56 
 
 
258 aa  54.7  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  42.68 
 
 
265 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  29.2 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  29.2 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  29.2 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  34.48 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  34.48 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  34.48 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  34.48 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  28.45 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  34.48 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  34.48 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  29.51 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  31.4 
 
 
272 aa  53.1  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  32.11 
 
 
264 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  29.63 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1788  hypothetical protein  34.48 
 
 
159 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  28.45 
 
 
178 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  29.63 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  31.75 
 
 
281 aa  52  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  27.52 
 
 
264 aa  51.2  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  28.32 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  28.32 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  28.32 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  34.38 
 
 
252 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  28.32 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  28.7 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  35.54 
 
 
336 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  28.32 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  28.7 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  28.7 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  30.58 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  33.75 
 
 
301 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  32.63 
 
 
264 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  34.23 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  32.03 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  28.28 
 
 
252 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  28.12 
 
 
195 aa  49.3  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  30.97 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  29.57 
 
 
256 aa  49.3  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  30.77 
 
 
264 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  30.28 
 
 
264 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  39.73 
 
 
251 aa  48.5  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0298  hypothetical protein  26.38 
 
 
232 aa  48.5  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  36.05 
 
 
259 aa  48.5  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  25.6 
 
 
224 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  33.04 
 
 
192 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>