91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4480 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 632 aa  1213    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  28.9 
 
 		 590 aa  84  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  26.03 
 
 		 613 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  29.32 
 
 		 564 aa  77.8  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  29.25 
 
 		 565 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  23.42 
 
 		 663 aa  71.6  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  20.85 
 
 		 544 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  20.89 
 
 		 547 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  21.29 
 
 		 547 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  27.94 
 
 		 578 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  20.63 
 
 		 549 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  20.94 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  20.94 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  21.31 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  29.12 
 
 		 560 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  20.04 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  20.67 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  26.69 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  28.54 
 
 		 528 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  34.15 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 172 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 		 122 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  31.63 
 
 		 124 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  32.65 
 
 		 124 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  32.65 
 
 		 124 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  38.46 
 
 		 593 aa  55.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  32.65 
 
 		 124 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  32.65 
 
 		 124 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  32.65 
 
 		 124 aa  55.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  32.65 
 
 		 124 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  33.64 
 
 		 141 aa  54.7  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  33.64 
 
 		 141 aa  54.7  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  32.65 
 
 		 124 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  31.63 
 
 		 124 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  39.6 
 
 		 189 aa  52  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  31.63 
 
 		 121 aa  52  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  35.05 
 
 		 144 aa  51.2  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  35.25 
 
 		 208 aa  51.2  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  32.8 
 
 		 559 aa  51.2  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  30.69 
 
 		 118 aa  51.2  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 		 193 aa  50.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 149 aa  50.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 		 160 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  37.35 
 
 		 314 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  33.19 
 
 		 513 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 125 aa  49.7  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  28.43 
 
 		 125 aa  49.7  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  30.61 
 
 		 124 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  30.61 
 
 		 124 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  32.84 
 
 		 605 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  33.81 
 
 		 173 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  26.12 
 
 		 173 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  30.61 
 
 		 124 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  30.61 
 
 		 124 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  30.61 
 
 		 124 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  29.17 
 
 		 128 aa  48.5  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  29.17 
 
 		 128 aa  48.5  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  37 
 
 		 512 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 124 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  28.97 
 
 		 127 aa  48.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  29.17 
 
 		 128 aa  48.5  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  35 
 
 		 519 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  27.27 
 
 		 121 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  31.17 
 
 		 588 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  27.27 
 
 		 121 aa  47.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  27.27 
 
 		 121 aa  47.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  30.63 
 
 		 571 aa  47.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  19.91 
 
 		 927 aa  47.4  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  29.82 
 
 		 210 aa  47  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  26.87 
 
 		 207 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  31 
 
 		 121 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5834  copper resistance protein CopC  32.58 
 
 		 120 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0327152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  36.14 
 
 		 314 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  31.75 
 
 		 126 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  30.84 
 
 		 130 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  29.82 
 
 		 687 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35 
 
 		 208 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  28.68 
 
 		 869 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  37.76 
 
 		 284 aa  45.8  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 		 111 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1734  hypothetical protein  34.34 
 
 		 165 aa  45.4  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  33.96 
 
 		 265 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  31.31 
 
 		 124 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  32.08 
 
 		 197 aa  45.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  37.25 
 
 		 217 aa  45.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0497  copper resistance protein CopC  38.78 
 
 		 120 aa  45.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  31.45 
 
 		 182 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.04 
 
 		 214 aa  44.7  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  29.2 
 
 		 170 aa  43.9  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  27.27 
 
 		 223 aa  43.9  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  31.73 
 
 		 203 aa  43.9  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>