169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2862 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  99.75 
 
 
4563 bp  4789    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  94.88 
 
 
3573 bp  1340    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  99.75 
 
 
4563 bp  4789    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  94.77 
 
 
3573 bp  1332    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1066    100 
 
 
2897 bp  2577    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1068  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1614  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2243  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0365379  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2369    100 
 
 
3548 bp  2573    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182688  normal  0.675739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2371  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2862    100 
 
 
5864 bp  11630    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427752  normal  0.514681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2863  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147732  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  92.56 
 
 
3573 bp  2135    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0574  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344122  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0620  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3688  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3700  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.484261  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4620  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4633  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4642  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5497  integrase catalytic subunit  100 
 
 
906 bp  1796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295724  normal  0.115233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1067  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.285311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1615  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146541  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2242  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.021715  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2370  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.695527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2864  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0966509  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0575  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725872  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0619  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3689  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547507  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4619  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4634  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4643  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5496  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
291 bp  577  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.30251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  96.94 
 
 
4743 bp  569  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  96.94 
 
 
4743 bp  569  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  96.33 
 
 
4743 bp  553  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3699    100 
 
 
165 bp  327  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.885653  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  79.18 
 
 
5439 bp  220  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  83.44 
 
 
5487 bp  202  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  82.78 
 
 
4746 bp  186  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  79.65 
 
 
5469 bp  151  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  79.73 
 
 
5472 bp  141  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  86.92 
 
 
6567 bp  101  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  82.63 
 
 
8958 bp  101  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  85.71 
 
 
5484 bp  101  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  83.01 
 
 
13437 bp  97.6  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  86.54 
 
 
6237 bp  95.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  87.37 
 
 
9765 bp  93.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5925  beta-ketoacyl synthase  84.43 
 
 
7935 bp  91.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103078 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  88.37 
 
 
4614 bp  91.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  78.59 
 
 
4734 bp  89.7  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  86 
 
 
5418 bp  87.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  88.31 
 
 
6678 bp  81.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.86 
 
 
9279 bp  79.8  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  88.89 
 
 
15768 bp  79.8  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  81.82 
 
 
10275 bp  77.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5495  AraC/XylS family transcriptional regulator  100 
 
 
930 bp  77.8  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143439  normal  0.457572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  94 
 
 
16203 bp  75.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  86.05 
 
 
12336 bp  75.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  90.32 
 
 
4647 bp  75.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3690  hypothetical protein  100 
 
 
456 bp  75.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91193  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  85.56 
 
 
4809 bp  75.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  85.71 
 
 
10284 bp  73.8  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  90.16 
 
 
12456 bp  73.8  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  97.56 
 
 
21633 bp  73.8  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  83.65 
 
 
6324 bp  71.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  91.07 
 
 
10482 bp  71.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  91.07 
 
 
9477 bp  71.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  84.21 
 
 
20670 bp  69.9  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  88.06 
 
 
10227 bp  69.9  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  89.83 
 
 
21333 bp  69.9  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  82.11 
 
 
7434 bp  69.9  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  82.35 
 
 
5421 bp  69.9  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  95.24 
 
 
5775 bp  67.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  92 
 
 
5463 bp  67.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  89.66 
 
 
4119 bp  67.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  83.02 
 
 
8643 bp  67.9  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  95.24 
 
 
14793 bp  67.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  93.33 
 
 
20307 bp  65.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  86.76 
 
 
8928 bp  63.9  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  86.76 
 
 
11091 bp  63.9  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  82.41 
 
 
5631 bp  63.9  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  91.49 
 
 
9138 bp  61.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5924  beta-ketoacyl synthase  85.33 
 
 
6606 bp  61.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0606388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  87.3 
 
 
3381 bp  61.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  83.16 
 
 
5235 bp  61.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  83.16 
 
 
5469 bp  61.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3479  beta-ketoacyl synthase  87.3 
 
 
1332 bp  61.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454254  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  86.57 
 
 
9447 bp  61.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  85.92 
 
 
5460 bp  61.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  84.34 
 
 
14523 bp  61.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  87.3 
 
 
11136 bp  61.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  87.3 
 
 
10392 bp  61.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  94.74 
 
 
6258 bp  60  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  94.74 
 
 
6258 bp  60  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  94.74 
 
 
6258 bp  60  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  88.68 
 
 
12807 bp  58  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  84.42 
 
 
9531 bp  58  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  83.81 
 
 
4425 bp  58  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  88.68 
 
 
13728 bp  58  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>