More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5925 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 		 5400 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  30.38 
 
 		 1939 aa  681    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  34.29 
 
 		 5255 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.63 
 
 		 2462 aa  726    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  34.78 
 
 		 3494 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  34.41 
 
 		 1832 aa  694    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 		 1874 aa  808    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.34 
 
 		 1804 aa  642    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  35.3 
 
 		 3645 aa  726    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.37 
 
 		 1867 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  29.14 
 
 		 3111 aa  638    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5925  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2644 aa  5190    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.103078 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  43.24 
 
 		 4478 aa  694    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  32.91 
 
 		 3711 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  31.96 
 
 		 1805 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  31.77 
 
 		 1966 aa  691    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  33.08 
 
 		 7279 aa  662    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  35.9 
 
 		 3176 aa  635  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  38.33 
 
 		 1656 aa  632  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.08 
 
 		 1354 aa  631  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 		 2551 aa  625  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  40.68 
 
 		 1587 aa  626  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  32.87 
 
 		 2890 aa  625  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  36.89 
 
 		 2762 aa  626  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 1816 aa  623  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  37.76 
 
 		 1087 aa  617  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.77 
 
 		 1337 aa  610  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  31.46 
 
 		 1806 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  33.89 
 
 		 1349 aa  609  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.75 
 
 		 1349 aa  610  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  32.34 
 
 		 1827 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.26 
 
 		 7110 aa  603  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.49 
 
 		 2880 aa  597  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  31.72 
 
 		 2551 aa  599  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  31.76 
 
 		 3508 aa  597  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  33.65 
 
 		 3676 aa  593  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  40.76 
 
 		 3696 aa  592  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  31.53 
 
 		 3101 aa  589  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  36.1 
 
 		 1559 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  33.07 
 
 		 3679 aa  581  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.03 
 
 		 1822 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.77 
 
 		 1559 aa  576  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  42.7 
 
 		 3693 aa  572  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  42.7 
 
 		 3693 aa  572  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.82 
 
 		 1372 aa  571  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  35.8 
 
 		 3408 aa  570  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  33.03 
 
 		 7210 aa  568  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  41.9 
 
 		 3702 aa  570  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  33.75 
 
 		 1820 aa  567  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 3874 aa  565  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  39.98 
 
 		 4080 aa  563  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  38.63 
 
 		 3099 aa  563  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  38.79 
 
 		 1144 aa  559  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  32.99 
 
 		 2847 aa  560  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  38.33 
 
 		 3337 aa  560  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  40.97 
 
 		 6889 aa  556  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  32.73 
 
 		 2232 aa  554  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  35 
 
 		 3449 aa  556  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  34.21 
 
 		 3930 aa  556  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  36.97 
 
 		 3252 aa  552  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.56 
 
 		 2136 aa  552  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  35.02 
 
 		 4151 aa  552  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  40.24 
 
 		 2477 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  40.96 
 
 		 3424 aa  546  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  41.08 
 
 		 2985 aa  545  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  37.76 
 
 		 1828 aa  546  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  33.91 
 
 		 2090 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  31.98 
 
 		 2230 aa  542  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  38.13 
 
 		 5154 aa  543  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  38.08 
 
 		 1581 aa  542  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0958  KR domain protein  33.39 
 
 		 2134 aa  543  9.999999999999999e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  38.29 
 
 		 1577 aa  540  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  34.51 
 
 		 4882 aa  539  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  35.35 
 
 		 3463 aa  537  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  37.16 
 
 		 1823 aa  535  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  38.26 
 
 		 2376 aa  531  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  34.09 
 
 		 2047 aa  531  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  34.48 
 
 		 2604 aa  530  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  39.41 
 
 		 4165 aa  529  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 		 3092 aa  524  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  34.5 
 
 		 1909 aa  527  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  33.03 
 
 		 4111 aa  522  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.92 
 
 		 1101 aa  522  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  34.18 
 
 		 3158 aa  524  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.22 
 
 		 950 aa  521  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  36.55 
 
 		 2966 aa  523  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  38.5 
 
 		 3254 aa  520  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  32.95 
 
 		 2220 aa  520  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  37.16 
 
 		 3427 aa  520  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  36.71 
 
 		 1580 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  36.71 
 
 		 1580 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  32.07 
 
 		 2277 aa  516  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  32.85 
 
 		 6768 aa  517  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  34.25 
 
 		 3670 aa  516  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  39.73 
 
 		 3045 aa  515  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  36.57 
 
 		 1819 aa  511  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  38.13 
 
 		 1658 aa  513  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  31.9 
 
 		 2333 aa  513  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  36.43 
 
 		 1580 aa  512  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  36.49 
 
 		 3033 aa  508  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>