More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0204 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0214  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0224  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0204  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 273 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0432  helix-turn-helix domain-containing protein  75.9 
 
 		 307 aa  418  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0236  helix-turn-helix domain-containing protein  73.76 
 
 		 351 aa  408  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0988  transcriptional regulator, AraC family  51.28 
 
 		 310 aa  257  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0224549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2203  Helix-turn-helix, AraC domain protein  47.14 
 
 		 311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263082  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2735  Helix-turn-helix, AraC domain protein  45.71 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.395  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2893  Helix-turn-helix, AraC domain protein  45.32 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2438  Helix-turn-helix, AraC domain protein  32.04 
 
 		 362 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170886  normal  0.130727 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  39.82 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  41.56 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3152  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294751  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  44 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  29.94 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  38.96 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  33.33 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  33.33 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  46.15 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  44.12 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 134 aa  52  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2556  AraC-like transcriptional regulator  40.54 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496188  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  36.36 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  36.36 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 160 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  36.36 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 250 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  41.33 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  36.36 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  41.33 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4739  DinB family protein  25.48 
 
 		 166 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  41.33 
 
 		 327 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 290 aa  49.7  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  34.67 
 
 		 286 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  33.8 
 
 		 1343 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0928  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 766 aa  49.3  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 282 aa  48.9  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  35.62 
 
 		 299 aa  48.9  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 289 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  37.33 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  37.33 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 329 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 156 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 303 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2766  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  30.33 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>