More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2195 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  782    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  29.41 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  28.24 
 
 
387 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  24.87 
 
 
386 aa  146  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  27.23 
 
 
385 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  26.13 
 
 
386 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  26.32 
 
 
386 aa  143  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  27.96 
 
 
386 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  26.13 
 
 
386 aa  126  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  27.14 
 
 
405 aa  126  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  26.45 
 
 
386 aa  126  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 
406 aa  122  9e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  27.58 
 
 
401 aa  121  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.69 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  25.94 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  26.81 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  26.59 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.91 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  26.81 
 
 
404 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  24.44 
 
 
397 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.88 
 
 
420 aa  116  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  30.07 
 
 
409 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  29.83 
 
 
409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  25.12 
 
 
391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  27.75 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  26.47 
 
 
647 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  29.59 
 
 
409 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  27.76 
 
 
386 aa  112  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  26.87 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  24.94 
 
 
397 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  27.23 
 
 
402 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  25.3 
 
 
406 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.19 
 
 
397 aa  111  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.3 
 
 
397 aa  110  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  26.24 
 
 
385 aa  110  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  23.94 
 
 
397 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  24.88 
 
 
397 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  25.66 
 
 
443 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  27.51 
 
 
649 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  25.98 
 
 
411 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  25.78 
 
 
400 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  23.44 
 
 
397 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  25.36 
 
 
401 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  26.51 
 
 
395 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.63 
 
 
424 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  27.59 
 
 
394 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 
398 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  25.67 
 
 
397 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.87 
 
 
416 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.56 
 
 
416 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  26.37 
 
 
389 aa  106  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  27.05 
 
 
409 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
409 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  27.49 
 
 
644 aa  105  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.14 
 
 
678 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  24.88 
 
 
397 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  27.67 
 
 
409 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  27.14 
 
 
678 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1761  hypothetical protein  28.47 
 
 
402 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000119528  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  27.14 
 
 
678 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  24.51 
 
 
397 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  26.63 
 
 
408 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  27.25 
 
 
657 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  26.95 
 
 
650 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  26.33 
 
 
671 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  27.25 
 
 
405 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  23.76 
 
 
397 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  24.77 
 
 
696 aa  103  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  23.93 
 
 
389 aa  103  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  24.39 
 
 
395 aa  102  9e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  26.49 
 
 
399 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  26.1 
 
 
658 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  25.12 
 
 
404 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.38 
 
 
413 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  26.13 
 
 
400 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  25.12 
 
 
401 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 
386 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.99 
 
 
656 aa  101  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  25.48 
 
 
652 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  25.65 
 
 
409 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  29.34 
 
 
654 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  25.07 
 
 
393 aa  100  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  26.09 
 
 
408 aa  100  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  25.06 
 
 
395 aa  100  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  26.52 
 
 
409 aa  99.8  7e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  25.18 
 
 
411 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  26.52 
 
 
409 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  26.65 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 
467 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  25.55 
 
 
405 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  25.83 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  26.75 
 
 
656 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  27.36 
 
 
417 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  25.36 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.45 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  23.79 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  25.55 
 
 
405 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  25.18 
 
 
403 aa  97.4  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  24.94 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>