More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2956 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  95.91 
 
 		 220 aa  427  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  91.13 
 
 		 203 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  91.13 
 
 		 203 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  85.71 
 
 		 203 aa  358  4e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  88.83 
 
 		 197 aa  353  8.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  88.32 
 
 		 197 aa  352  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  88.32 
 
 		 197 aa  352  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  88.32 
 
 		 197 aa  352  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  87.31 
 
 		 197 aa  350  8e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  81.95 
 
 		 205 aa  341  4e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  91.11 
 
 		 180 aa  332  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  70.87 
 
 		 209 aa  296  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  71.08 
 
 		 208 aa  294  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  72.73 
 
 		 204 aa  288  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  71.79 
 
 		 206 aa  284  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  67.17 
 
 		 200 aa  272  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  64.21 
 
 		 199 aa  257  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  63.68 
 
 		 199 aa  256  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  69.06 
 
 		 181 aa  253  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  60.82 
 
 		 212 aa  238  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  60.82 
 
 		 239 aa  237  9e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  59.52 
 
 		 208 aa  231  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  61.32 
 
 		 213 aa  230  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  59.09 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  59.6 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  60.1 
 
 		 215 aa  224  7e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  61.29 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  61.81 
 
 		 213 aa  222  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  57.35 
 
 		 215 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  57.62 
 
 		 211 aa  218  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  61.29 
 
 		 205 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  56.78 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  58.2 
 
 		 194 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  58.29 
 
 		 218 aa  214  9e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  56.57 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  54.29 
 
 		 223 aa  208  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  52.28 
 
 		 217 aa  201  9e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  53.06 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  58.69 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  49.02 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  45.65 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  38.78 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  37.62 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  35.41 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  37.74 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  39.13 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  36.68 
 
 		 198 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  37.5 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  38.8 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  38.8 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  36.32 
 
 		 206 aa  115  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  35.5 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  33.82 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  37.5 
 
 		 195 aa  111  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  38.38 
 
 		 743 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  34.43 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  36.32 
 
 		 292 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  36.32 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  42.86 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  36.76 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  37.99 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  38.16 
 
 		 285 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  38.16 
 
 		 285 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  40.26 
 
 		 293 aa  101  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  36.56 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  37.68 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  38.89 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.18 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  34.69 
 
 		 291 aa  99.4  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  34.96 
 
 		 286 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.18 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  37.97 
 
 		 285 aa  99  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  34.39 
 
 		 201 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.05 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  39.04 
 
 		 287 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  30.32 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  33.69 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  34.68 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  36.93 
 
 		 298 aa  97.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  34.29 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  36.36 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  32.37 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  36.82 
 
 		 439 aa  97.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.96 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  36.36 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.68 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.68 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  37.31 
 
 		 292 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  36.82 
 
 		 292 aa  96.7  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0616  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  31.87 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  41.86 
 
 		 294 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.15 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.15 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  36.9 
 
 		 285 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0161  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.6 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  34.69 
 
 		 291 aa  95.5  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  33.67 
 
 		 291 aa  95.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.91 
 
 		 199 aa  95.1  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>