More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2732 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  89.68 
 
 
504 aa  868    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.95 
 
 
504 aa  654    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  85.54 
 
 
505 aa  852    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  78.04 
 
 
505 aa  783    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  85.54 
 
 
505 aa  852    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  85.54 
 
 
505 aa  852    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
504 aa  1025    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.27 
 
 
505 aa  642    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  63.2 
 
 
499 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  64.27 
 
 
498 aa  619  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  61.45 
 
 
522 aa  618  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61.86 
 
 
523 aa  614  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.21 
 
 
503 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.76 
 
 
503 aa  599  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.1 
 
 
517 aa  595  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.72 
 
 
514 aa  586  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  59.68 
 
 
513 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.12 
 
 
507 aa  484  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.03 
 
 
546 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.4 
 
 
528 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  42.12 
 
 
542 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.63 
 
 
552 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.57 
 
 
544 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.76 
 
 
543 aa  364  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.73 
 
 
529 aa  348  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.12 
 
 
547 aa  346  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.02 
 
 
495 aa  326  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.77 
 
 
477 aa  293  7e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.88 
 
 
488 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.3 
 
 
479 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.23 
 
 
478 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.24 
 
 
484 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.38 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.98 
 
 
480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  31.21 
 
 
480 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.79 
 
 
480 aa  193  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  40.62 
 
 
512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.23 
 
 
480 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.33 
 
 
480 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.69 
 
 
480 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  30.39 
 
 
477 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.79 
 
 
479 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.79 
 
 
479 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.69 
 
 
478 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.1 
 
 
480 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.19 
 
 
454 aa  177  5e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.6 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  28.78 
 
 
477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  28.4 
 
 
488 aa  173  5.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  31.74 
 
 
481 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  31.62 
 
 
489 aa  172  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  31.82 
 
 
478 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.33 
 
 
478 aa  169  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.47 
 
 
475 aa  167  5.9999999999999996e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  34.2 
 
 
430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.11 
 
 
483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.63 
 
 
481 aa  160  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.5 
 
 
478 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  31.78 
 
 
477 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  31.78 
 
 
477 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  31.78 
 
 
477 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  31.78 
 
 
477 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  31.78 
 
 
477 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  31.78 
 
 
477 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  31.78 
 
 
477 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.99 
 
 
458 aa  152  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.23 
 
 
457 aa  145  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.56 
 
 
473 aa  143  7e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.42 
 
 
474 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.87 
 
 
458 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.87 
 
 
458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.97 
 
 
457 aa  131  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.16 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.21 
 
 
443 aa  128  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.72 
 
 
459 aa  122  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.48 
 
 
458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.11 
 
 
461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  25.11 
 
 
445 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.53 
 
 
456 aa  113  8.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.98 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.5 
 
 
458 aa  111  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  23.85 
 
 
458 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.07 
 
 
491 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.33 
 
 
462 aa  103  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.52 
 
 
454 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.52 
 
 
460 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.21 
 
 
460 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.85 
 
 
442 aa  101  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.65 
 
 
479 aa  100  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1846  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24 
 
 
459 aa  100  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0233195 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.88 
 
 
497 aa  99  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.17 
 
 
437 aa  98.6  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.46 
 
 
473 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  26.03 
 
 
473 aa  97.4  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.83 
 
 
490 aa  97.1  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.36 
 
 
477 aa  96.3  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.41 
 
 
489 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.67 
 
 
480 aa  94  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  25.36 
 
 
460 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.81 
 
 
486 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>