More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0517 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  66.67 
 
 
512 aa  684    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  66.93 
 
 
513 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  67.06 
 
 
514 aa  706    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  67.32 
 
 
513 aa  675    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1018  2-isopropylmalate synthase  67.45 
 
 
514 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284952  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  77.06 
 
 
527 aa  798    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  75.25 
 
 
513 aa  796    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  66.34 
 
 
513 aa  676    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  78.39 
 
 
511 aa  818    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  66.86 
 
 
515 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  66.73 
 
 
515 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  68.04 
 
 
511 aa  710    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  67.06 
 
 
514 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  66.47 
 
 
514 aa  692    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  75.49 
 
 
511 aa  788    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  72.1 
 
 
510 aa  742    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  66.34 
 
 
515 aa  670    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  65.75 
 
 
512 aa  669    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  68.3 
 
 
515 aa  697    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  67.84 
 
 
513 aa  686    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  71.65 
 
 
516 aa  733    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  65.62 
 
 
512 aa  670    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  66.14 
 
 
515 aa  681    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 
515 aa  1054    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  66.47 
 
 
513 aa  679    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  66.67 
 
 
515 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  70.2 
 
 
513 aa  700    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  67.71 
 
 
513 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1058  2-isopropylmalate synthase  64.6 
 
 
515 aa  654    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  66.86 
 
 
514 aa  688    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2176  2-isopropylmalate synthase  66.86 
 
 
514 aa  673    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  67.25 
 
 
517 aa  691    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2298  2-isopropylmalate synthase  66.67 
 
 
514 aa  672    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1279  2-isopropylmalate synthase  66.73 
 
 
515 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  66.86 
 
 
514 aa  688    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  66.86 
 
 
514 aa  688    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1286  2-isopropylmalate synthase  66.73 
 
 
515 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  66.67 
 
 
516 aa  684    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0815  2-isopropylmalate synthase  64.8 
 
 
515 aa  665    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  67.39 
 
 
512 aa  694    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  67.65 
 
 
516 aa  702    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  67.91 
 
 
516 aa  706    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  66.8 
 
 
512 aa  682    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  64.05 
 
 
512 aa  668    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  67.19 
 
 
512 aa  692    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  66.73 
 
 
513 aa  669    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3626  2-isopropylmalate synthase  65.62 
 
 
512 aa  669    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  66.47 
 
 
513 aa  680    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  68.11 
 
 
516 aa  699    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  70.2 
 
 
513 aa  700    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  60.56 
 
 
513 aa  591  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  58.88 
 
 
516 aa  570  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  57.31 
 
 
512 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  57.85 
 
 
513 aa  551  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  56.6 
 
 
507 aa  549  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  56.11 
 
 
519 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  54.1 
 
 
524 aa  547  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  55.6 
 
 
520 aa  547  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  56.11 
 
 
504 aa  545  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  57.17 
 
 
512 aa  543  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  56.48 
 
 
518 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  57.89 
 
 
514 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  56.34 
 
 
503 aa  539  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  56.4 
 
 
505 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  55.4 
 
 
511 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0586  2-isopropylmalate synthase  53.02 
 
 
524 aa  538  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.237599  hitchhiker  0.000000030119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  55.66 
 
 
516 aa  537  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  53.15 
 
 
524 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  52.54 
 
 
546 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  56.49 
 
 
525 aa  533  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  55.75 
 
 
532 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  56.68 
 
 
509 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  55.16 
 
 
504 aa  531  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  52.65 
 
 
539 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  52.65 
 
 
539 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  55.09 
 
 
515 aa  528  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  53.66 
 
 
509 aa  530  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0491  2-isopropylmalate synthase  53.8 
 
 
504 aa  529  1e-149  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  54.51 
 
 
506 aa  529  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  54.58 
 
 
536 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  55.19 
 
 
508 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  53.15 
 
 
520 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  51.54 
 
 
556 aa  527  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  54.23 
 
 
510 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  53.47 
 
 
536 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  54.58 
 
 
536 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  52.04 
 
 
529 aa  525  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  51.84 
 
 
529 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  52.08 
 
 
532 aa  521  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  55.31 
 
 
507 aa  522  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  54.89 
 
 
517 aa  523  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  51.54 
 
 
556 aa  524  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  54.89 
 
 
515 aa  524  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  52.23 
 
 
529 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  51.97 
 
 
527 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  52.95 
 
 
520 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  52.76 
 
 
520 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  52.66 
 
 
521 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  53.66 
 
 
541 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  51.86 
 
 
521 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>