More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0168 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  100 
 
 
356 aa  703    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  71.23 
 
 
467 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  69.76 
 
 
357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  69.46 
 
 
359 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  72.68 
 
 
355 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  73.35 
 
 
357 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  73.35 
 
 
357 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  73.35 
 
 
357 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  73.05 
 
 
357 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  67.42 
 
 
357 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  66.01 
 
 
357 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  63.17 
 
 
356 aa  415  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  64.86 
 
 
363 aa  411  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  66.77 
 
 
356 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  60.54 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  67.88 
 
 
356 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  67.88 
 
 
356 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  63.05 
 
 
355 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  59.28 
 
 
357 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  59.64 
 
 
354 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  57.39 
 
 
357 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  58.09 
 
 
382 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  58.14 
 
 
355 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  58.14 
 
 
355 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  58.14 
 
 
355 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  58.14 
 
 
355 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  58.14 
 
 
355 aa  368  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  58.14 
 
 
355 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  58.31 
 
 
355 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  58.18 
 
 
358 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  62.17 
 
 
355 aa  361  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  62.46 
 
 
391 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  60.56 
 
 
355 aa  359  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  57.35 
 
 
355 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  57.76 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  59.77 
 
 
357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  57.94 
 
 
355 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  57.94 
 
 
355 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  57.94 
 
 
355 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  57.65 
 
 
355 aa  348  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  58.84 
 
 
358 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  59.76 
 
 
356 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  58.01 
 
 
358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  59.88 
 
 
356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  58.68 
 
 
356 aa  332  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  56.75 
 
 
389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  52.63 
 
 
350 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  53.51 
 
 
355 aa  289  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  49.14 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  78.26 
 
 
161 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  52.13 
 
 
429 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  43.55 
 
 
365 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  46.89 
 
 
343 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  46.04 
 
 
350 aa  249  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  42.52 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  45.12 
 
 
343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  43.67 
 
 
348 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  45.12 
 
 
343 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  45.12 
 
 
339 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  43.52 
 
 
331 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  41.92 
 
 
351 aa  237  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  43.03 
 
 
321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  40.75 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  45.13 
 
 
321 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  42.24 
 
 
328 aa  223  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  42.07 
 
 
437 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  43.3 
 
 
332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  38.87 
 
 
341 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  38.9 
 
 
334 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  38.92 
 
 
356 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 
319 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 
319 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  40.92 
 
 
331 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  40.92 
 
 
331 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  43.03 
 
 
331 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  37.6 
 
 
332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1311  hypothetical protein  67.41 
 
 
195 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  48.39 
 
 
284 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  31.16 
 
 
335 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 
329 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  31.29 
 
 
321 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  31.76 
 
 
329 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  31.88 
 
 
332 aa  123  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  31.43 
 
 
328 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  31.43 
 
 
328 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  29.91 
 
 
354 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  32.78 
 
 
320 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.04 
 
 
335 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  29.28 
 
 
371 aa  116  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  27.2 
 
 
425 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  31.48 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  29.14 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  35.34 
 
 
355 aa  109  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  26.01 
 
 
368 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  29.13 
 
 
328 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  27.46 
 
 
348 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  30.9 
 
 
335 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  30.92 
 
 
333 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  28.2 
 
 
339 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>