More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl583 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl583  DNA polymerase III alpha subunit  100 
 
 
992 aa  2009    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0637  DNA-directed DNA polymerase III (polc)  49.2 
 
 
986 aa  878    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0459907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  33.9 
 
 
1108 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  33.84 
 
 
1108 aa  557  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  33.84 
 
 
1108 aa  558  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  33.62 
 
 
1108 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  33.84 
 
 
1108 aa  558  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  33.65 
 
 
1108 aa  556  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  33.56 
 
 
1108 aa  556  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  33.4 
 
 
1110 aa  557  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  33.4 
 
 
1109 aa  557  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  33.75 
 
 
1108 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  33.87 
 
 
1108 aa  555  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1759  DNA polymerase III, alpha subunit  33.87 
 
 
1065 aa  532  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.463991  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  33.93 
 
 
1065 aa  531  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1793  DNA polymerase III, alpha subunit  33.87 
 
 
1065 aa  532  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  33.75 
 
 
1104 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  32.43 
 
 
1134 aa  526  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  33.08 
 
 
1127 aa  511  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0460  DNA polymerase III DnaE  34.47 
 
 
969 aa  510  1e-143  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1000  DNA polymerase III, alpha subunit  35.39 
 
 
960 aa  509  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  36.82 
 
 
1115 aa  508  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0774  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  33.07 
 
 
1112 aa  506  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  36.24 
 
 
1139 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0880  DNA polymerase III, alpha subunit  32.66 
 
 
1038 aa  500  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191787  hitchhiker  0.00000000000153929 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  31.98 
 
 
1130 aa  496  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  30.78 
 
 
1145 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  36.1 
 
 
1181 aa  496  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  31.31 
 
 
1225 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  35.3 
 
 
1145 aa  490  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf612  DNA polymerase III subunit alpha  37.39 
 
 
999 aa  491  1e-137  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.415572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  32.68 
 
 
1075 aa  485  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  30.87 
 
 
1156 aa  484  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  33.4 
 
 
1182 aa  483  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.836983  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  37.76 
 
 
1200 aa  484  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  38.39 
 
 
1200 aa  482  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1288  DNA polymerase III subunit alpha  38.46 
 
 
1200 aa  480  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  31.98 
 
 
1159 aa  482  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  34.19 
 
 
1165 aa  476  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0892  DNA polymerase III subunit alpha  38.2 
 
 
1197 aa  477  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0260823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  34.96 
 
 
1184 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  36.83 
 
 
1149 aa  473  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  32.84 
 
 
1156 aa  476  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  36.93 
 
 
1186 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  32.74 
 
 
1155 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  33.49 
 
 
1148 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  32.74 
 
 
1156 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  29.37 
 
 
1092 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  31.26 
 
 
1190 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0939  DNA polymerase III DnaE  31.5 
 
 
1034 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  34.42 
 
 
1158 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  30.8 
 
 
1155 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  32.31 
 
 
1122 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3593  DNA polymerase III, alpha subunit  28.83 
 
 
1210 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3525  DNA polymerase III, alpha subunit  28.83 
 
 
1210 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  30.59 
 
 
1143 aa  467  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  30.4 
 
 
1148 aa  469  9.999999999999999e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  29.7 
 
 
1159 aa  467  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  33.67 
 
 
1139 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  30.43 
 
 
1143 aa  465  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  31.38 
 
 
1148 aa  465  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  31.47 
 
 
1148 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1538  DNA polymerase III subunit alpha  37.4 
 
 
1213 aa  463  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  32.84 
 
 
1171 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  33.8 
 
 
1179 aa  465  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0485  DNA polymerase III subunit alpha  36.66 
 
 
1203 aa  465  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1747  DNA polymerase III, alpha subunit  31.88 
 
 
1122 aa  465  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01387  DNA polymerase III subunit alpha  35.44 
 
 
1154 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2126  DNA polymerase III subunit alpha  35.18 
 
 
1257 aa  462  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.794686  normal  0.520943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  28.76 
 
 
1210 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  29.14 
 
 
1173 aa  462  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0921  DNA polymerase III subunit alpha  35.23 
 
 
1165 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148077  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  34.18 
 
 
1190 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  33.41 
 
 
1155 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0812  DNA polymerase III, alpha subunit  29.32 
 
 
1189 aa  459  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0506  DNA polymerase III subunit alpha  36.09 
 
 
1201 aa  457  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0893  DNA polymerase III, alpha subunit  29.99 
 
 
1189 aa  458  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323768  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  30.17 
 
 
1165 aa  458  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  30.34 
 
 
1160 aa  459  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  35.96 
 
 
1175 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  28.82 
 
 
1168 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1742  DNA polymerase III subunit alpha  34.64 
 
 
1179 aa  458  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209003  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  35.09 
 
 
1240 aa  457  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  36.04 
 
 
1201 aa  455  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00506055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1283  DNA polymerase III subunit alpha  35.39 
 
 
1165 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197401  normal  0.0648697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  29.26 
 
 
1217 aa  456  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  27.9 
 
 
1182 aa  455  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1165  DNA polymerase III DnaE  31.02 
 
 
1036 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  34.86 
 
 
1164 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  32.75 
 
 
1157 aa  450  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  29.6 
 
 
1173 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  32.88 
 
 
1172 aa  452  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  30.79 
 
 
1158 aa  452  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  36.27 
 
 
1186 aa  451  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  32.58 
 
 
1172 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1547  DNA polymerase III, alpha subunit  30.22 
 
 
1189 aa  452  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  33.37 
 
 
1159 aa  450  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  35.05 
 
 
1155 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  33.89 
 
 
1151 aa  451  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1762  DNA polymerase III subunit alpha  32.37 
 
 
1156 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402462  normal  0.434108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>