280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4815 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  97.55 
 
 		 531 aa  1024    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.75 
 
 		 525 aa  653    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  68.98 
 
 		 508 aa  736    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  66.36 
 
 		 534 aa  716    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  89.83 
 
 		 530 aa  959    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  61.3 
 
 		 541 aa  641    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  66.85 
 
 		 522 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  73.46 
 
 		 517 aa  771    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  62.83 
 
 		 524 aa  635    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  69.76 
 
 		 546 aa  742    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  77.82 
 
 		 506 aa  786    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.19 
 
 		 531 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  69.13 
 
 		 541 aa  740    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  64.22 
 
 		 519 aa  679    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  70.56 
 
 		 530 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  69.39 
 
 		 535 aa  738    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  70.59 
 
 		 540 aa  769    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  66.36 
 
 		 534 aa  716    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  63.57 
 
 		 528 aa  684    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 		 531 aa  1070    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  81.94 
 
 		 532 aa  842    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  63.57 
 
 		 526 aa  678    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.93 
 
 		 525 aa  655    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  60.74 
 
 		 536 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56.64 
 
 		 525 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  55.72 
 
 		 523 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56.19 
 
 		 526 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  55.45 
 
 		 523 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.39 
 
 		 544 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.87 
 
 		 507 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.25 
 
 		 508 aa  329  6e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.7 
 
 		 508 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.7 
 
 		 508 aa  326  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34 
 
 		 508 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.04 
 
 		 508 aa  325  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.25 
 
 		 533 aa  322  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.46 
 
 		 508 aa  319  7.999999999999999e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.97 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.3 
 
 		 535 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.09 
 
 		 532 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.2 
 
 		 563 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.93 
 
 		 540 aa  306  6e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.06 
 
 		 535 aa  301  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.02 
 
 		 568 aa  300  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.89 
 
 		 535 aa  294  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.48 
 
 		 525 aa  288  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.05 
 
 		 480 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  29 
 
 		 488 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  27.29 
 
 		 488 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  27.29 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  26.4 
 
 		 482 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  27.78 
 
 		 488 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  27.78 
 
 		 488 aa  107  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  26.93 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  26.03 
 
 		 494 aa  103  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  28.47 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  25.93 
 
 		 482 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  26.51 
 
 		 483 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  26.18 
 
 		 485 aa  99.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  27.36 
 
 		 483 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  25.82 
 
 		 480 aa  95.5  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  26.56 
 
 		 509 aa  94.4  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  27.89 
 
 		 491 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  27.89 
 
 		 491 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  26.98 
 
 		 491 aa  91.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  25.76 
 
 		 466 aa  90.9  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0236  oxidoreductase/nitrogenase component 1  27.14 
 
 		 348 aa  90.9  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.690347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.35 
 
 		 425 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  25.17 
 
 		 472 aa  89  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  24.59 
 
 		 462 aa  88.2  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  27.52 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  23.36 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  20.62 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  23.66 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  23.45 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  29.1 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  29.36 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  23.12 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.72 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  25.66 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  25.05 
 
 		 493 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  25 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  30.86 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  26.12 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.37 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  24.91 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.73 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.81 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  23.1 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.72 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  24.86 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  23.62 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.21 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1534  nitrogenase  24.13 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.898228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.21 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  22.73 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  28 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  20.56 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1012  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.43 
 
 		 510 aa  67  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245367  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1235  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  23.77 
 
 		 463 aa  67  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>